畜牧兽医学报

作者：郑云畅, 侯睿霖, 梁晓贺, 魏子露, 杨利丹, 霍浩楠, 苏硕青, 张萃, 李树静, 李世杰

单位：1.河北农业大学生命科学学院，保定 071001；2.河北天和肉牛种业有限公司，石家庄 050200

关键词：DLK1-DIO3印记区域,转录组,甲基化组,牛,胎盘

基金：河北省自然科学基金(C2023204145);河北省现代农业产业技术体系建设专项(HBCT2024240206);河北省现代农业产业技术体系建设专项(HBCT2024240101);中央引导地方科技发展资金项目(246Z2914G)

旨在研究牛DLK1-DIO3区域的印记状态和DNA差异甲基化区（differentially methylated regions，DMRs）。对3个牛的胎盘、及其亲本进行全基因组测序（whole genome sequencing，WGS），挖掘单核苷酸多态（single nucleotide polymorphism，SNP）信息；联合转录组测序（RNA-sequencing，RNA-seq）数据，确定基因的印记状态；联合全基因组亚硫酸盐测序（whole genome bisulfite sequencing，WGBS）数据，确定DNA的差异甲基化区。WGS与RNA-seq测序结果联合分析表明，牛MEG3、MEG8和MEG9基因为母源等位基因表达的印记基因，DLK1、RTL1和DIO3基因为父源等位基因表达的印记基因。WGBS数据分析发现，除与人和小鼠保守的Dlk1-DMR、IG-DMR、Gtl2-DMR和Meg8-DMR外，还发现5个新的DMRs，分别为位于DLK1基因上游的DLK1-DMR0和DLK1-DMR1、MEG9启动子区域的MEG9-DMR及DIO3上游的DIO3-DMR1和DIO3-DMR2。上述结果表明，DLK1-DIO3印记区域的印记状态和差异甲基化区在牛、人和小鼠中高度保守，此外，新发现了5个DMRs，其对DLK1-DIO3区域的调控机制有待于进一步研究。

来源：2026年第2期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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