畜牧兽医学报

作者：许黎明, 张聪, 温墩, 饶肇玺, 郝韵, 刘俊逸, 杜陶然, 王文强, 李强, 李平华, 黄瑞华

单位：1.南京农业大学养猪研究所农业农村部遗传资源猪评价与利用重点实验室南京，南京 210095；2.南京农业大学生命科学学院，南京 210095；3.南京农业大学淮安研究院，淮安 223005；4.淮安市淮阴新淮种猪场，淮安 223322

关键词：猪,粗纤维表观消化率,基因,QTL

基金：江苏省农业科学自主创新资金项目（CX（20）1003）;国家重点研发计划(2021YFD13011503)

旨在挖掘影响苏淮猪（25%淮猪血统和75%大白猪血统）粗纤维表观消化率的功能候选基因，为解析猪粗纤维表观消化率的遗传机制奠定基础。本研究选取320头160日龄苏淮猪作为试验对象，通过测定饲料与粪便的粗纤维含量计算表观消化率。同时采集耳组织样品进行80K单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）芯片分型，经质控后保留51 625个SNPs，基于芯片数据计算遗传力，并将芯片数据填充至重测序水平。随后基于填充数据开展全基因组关联分析（genome-wide association study，GWAS），并利用贝叶斯精细定位方法进行深入分析。结果表明，该群体粗纤维表观消化率为54.30%±1.03%，变异系数为33.87%，表型变异较大，具有一定的选育空间。遗传力计算结果为0.268±0.106（P=0.012），属于中等遗传力性状。GWAS分析在4号、5号和9号染色体上鉴别到359个与粗纤维表观消化率显著相关的SNPs（P<3.30×10-6）。贝叶斯精细定位确定了3个数量性状基因座（quantitative trait locus，QTL）区间，分别位于4号染色体11.48~12.75 Mb、5号染色体83.39~84.86 Mb和9号染色体18.81~19.68 Mb，经与Pig QTL数据库比对，均为新发现的影响猪粗纤维表观消化率的QTL。进一步通过数据库与文献检索确定了6个功能候选基因MYC、ANO4、NR1H4、ACTR6、SCYL2和DLG2。利用FarmGTEx项目的PigBiobank数据库对候选基因进行 PheWAS分析，发现这些基因与猪的日增重、肉色及健康等性状显著相关。本研究新发现了3个影响猪粗纤维消化的QTL以及6个功能候选基因，为纤维表观消化率性状的遗传分子机制研究和分子育种提供了前期基础。

来源：2026年第1期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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