畜牧兽医学报

作者：王言, 顾以韧, 张进威, 杨雪梅, 梁艳, 刘锐, 陶璇, 杨跃奎, 安瑞, 杨坤, 张兴, 陈晓晖, 龚建军

单位：1.四川省畜牧科学研究院，畜禽种业四川省重点实验室，成都 610066；2.西南民族大学畜牧兽医学院，成都 610041；3.重庆市畜牧科学院，重庆 402460；4.农业农村部养猪科学重点实验室 养猪科学重庆市重点实验室，重庆 402460

关键词：川乡黑猪,巴克夏猪,杜洛克猪,16SrRNA,微生物多样性

基金：农业农村部养猪科学重点实验室开放课题(24507C);省财政运行专项(SASA2025CZYX001);现代农业产业技术体系四川生猪创新团队(SCCXTD-2025-08);国家现代农业产业技术体系(CARS-35)

旨在通过16S rRNA测序技术和生物信息学分析手段探究川乡黑猪、巴克夏猪、杜洛克猪肠道微生物的多样性差异。川乡黑猪、巴克夏猪、杜洛克猪在体重达120 kg时进行屠宰，屠宰时采集3个猪种直肠的粪便，利用16S rRNA测序技术和生物信息学手段对不同猪种肠道微生物多样性进行分析。结果表明，巴克夏猪的菌群多样性显著低于川乡黑猪和杜洛克猪（P<0.05），3个猪种的菌群群落结构有显著差异（P<0.05）。在门水平，川乡黑猪厚壁菌门（Firmicutes）丰度显著低于巴克夏猪（P<0.05），川乡黑猪和杜洛克猪的拟杆菌门（Bacteroidota）丰度显著高于巴克夏猪（P<0.05）。在属水平，川乡黑猪和杜洛克猪的理研菌科RC9菌属丰度（Rikenellaceae RC9 gutgroup）显著高于巴克夏猪（P<0.05），川乡黑猪普雷沃氏菌属（Prevotella）、普雷沃氏菌科NK3B31菌属（Prevotellaceae NK3B31group）丰度显著高于杜洛克猪和巴克夏猪（P<0.05），杜洛克和巴克夏猪狭义梭菌属 1（Clostridium sensu stricto 1）丰度显著高于川乡黑猪（P<0.05）；LEfSe分析显示，在属水平上，川乡黑猪、巴克夏猪、杜洛克猪中分别存在14种、7种、1种差异微生物；功能预测结果显示，川乡黑猪的微生物群落中与氨基酸代谢相关的通路显著富集，巴克夏猪中与丙酮酸代谢等相关的通路显著富集，杜洛克猪中与蛋白质运输等相关的通路显著富集。综上所述，川乡黑猪、巴克夏猪和杜洛克猪的肠道微生物组成和功能存在显著差异，这些差异可能影响宿主的营养代谢、能量利用和免疫调节等功能。

来源：2026年第1期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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