畜牧兽医学报

作者：孔令锋, 朱丽君, 厉彦浩, 彭玉薇, 寇富民, 李亮, 刘书东

单位：1. 塔里木大学动物科学与技术学院, 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室, 阿拉尔 843300；2. 农业农村部环塔里木畜草资源利用重点实验室, 阿拉尔 843300；3. 新疆维吾尔自治区畜牧总站, 乌鲁木齐 830004

关键词：南疆地方绵羊,群体遗传结构,芯片,ROH分析,FST分析

基金：中央引导地方发展基金项目(ZYYD2025CG13)；新疆维吾尔自治区重大科技专项项目(2024A02004-4-4)；羊精液低温长效保存关键技术创新与产业化应用(ZYYD2025CG13)；自治区牧区地方肉羊品种选育推广技术体系(MQTX-11)

旨在挖掘绵羊中与优异性状相关基因，对遗传改良与育种实践具有重要价值。本研究以93只策勒黑羊、33只皮山红羊和13只瓦格吉尔羊为对象，进行颈静脉采血、DNA提取、基因分型。用PLINK软件对基因型数据进行质量控制(质控标准为：剔除个体检出率小于90%、SNP检出率小于95%、最小等位基因频率小于5%、哈代温伯格平衡P < 1×10-6的SNPs)和主成分分析(PCA)，构建进化树、群体祖先成分分析和连锁不平衡分析(LD)，同时基于全基因组长纯合片段(runs of homozygosity, ROH)分析和群体遗传分化指数(FST)分析，选择前10%的ROH片段作为高频区域和FST值的前5%位点作为受选择区域，参考绵羊基因组Oar＿v4.0注释基因并进行GO和KEGG分析。FST和FROH结果表明，3个群体之间遗传分化水平较低，且在K=4呈现清晰的遗传背景分化。同时识别出ACVR1、ACVR1C、UPP2、CRY1和NR4A2等是南疆地方绵羊品种在干旱沙漠环境中形成遗传适应性的候选基因。本研究通过群体遗传结构多样性和选择信号分析，揭示了南疆地方绵羊品种的遗传变异特征，从多维度的遗传变异视角寻找到相关优异基因，为绵羊种质资源保护、新品种培育及资源多样性提升提供了重要参考依据。

来源：2025年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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