畜牧兽医学报

作者：滕兴怡, 王宝维, 张名爱, 孔敏, 舒音东, 王丰好, 姜雅静, 鲁秀, 怀志芳, 臧玉婷, 黄鲁豫, 凡文磊

单位：1. 青岛农业大学动物科技学院, 青岛 266109；2. 青岛农业大学优质水禽研究所, 青岛 266109；3. 昆明市东川区动物疫病预防控制中心, 昆明 654100；4. 莱西市农业农村局, 青岛 266600

关键词：豁眼鹅,保种效果,全基因组重测序,遗传多样性,近交

基金：国家自然科学基金青年项目(32202668)；云南省科技厅科技计划项目(202404BP090010)；国家重点研发计划(2023YFD1300305)；国家水禽产业技术体系(CARS-42-14)

旨在利用全基因组重测序技术分析豁眼鹅(五龙鹅)群体遗传多样性，评估种质资源保护状况，为后续保种工作提供参考。本研究从山东莱阳豁眼鹅(五龙鹅)保种场随机选取了40只公鹅进行全基因组重测序，分析了其遗传多样性、群体遗传结构和连续纯合片段等。结果表明，40只豁眼鹅(五龙鹅)平均测序深度为13×，质控后共鉴定到13 251 291个SNPs位点。群体遗传多样性分析发现，本保种群体平均多态信息含量(PIC)为0.264，平均观察杂合度(Ho)为0.323，平均期望杂合度(He)为0.327，群体近亲系数(F)为0.012。LD衰减分析结果可知，最大R2值为0.47，衰减距离为162 kb。豁眼鹅(五龙鹅)保种群体共检测到309个连续纯合片段(ROH)，基于ROH值计算得出的近交系数(FROH)为0.009，表明群体近交程度较低。IBS距离矩阵和G矩阵的结果趋势相似，只有少部分的个体间亲缘关系较近。主成分分析与NJ聚类分析结果同样显示, 保种群总体呈离散状态。总体而言，本次调查的山东莱阳豁眼鹅(五龙鹅)保种场种群遗传多样性良好、近交程度较低，保种效果良好。

来源：2025年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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