畜牧兽医学报

作者：张怡然, 毛楠楠, 王韵龙, 周荣艳, 臧素敏, 谢辉, 王文君, 张维娅

单位：1. 河北农业大学动物科技学院, 保定 071001；2. 阜平硒鸽实业有限公司, 阜平 073200；3. 河北省肉鸽产业技术研究院, 阜平 073200

关键词：乳鸽,胸肌,全基因组,转录组,选择信号,SNPs

基金：河北省高等学校科学研究项目(CXZX2025067)；保定市科技计划“揭榜挂帅”项目(2024农208)；河北省现代农业产业技术体系蛋禽创新团队良繁体系与品种培育岗(HBCT2024260204)

旨在通过分析2个种群鸽的全基因组SNPs位点及胸肌的转录组数据，鉴定与28日龄乳鸽胸肌率相关的候选基因。本研究选取M系和B系鸽各10只进行全基因组测序，提取并筛选SNPs位点后进行全基因组选择信号分析。选取两个种群中胸肌率存在显著差异的10只28日龄乳鸽，采集胸肌进行转录组测序，分析胸肌中基因表达水平以及差异表达基因，并结合选择信号分析筛选与28日龄乳鸽胸肌率相关的关键基因。利用实时荧光定量PCR对9个与肌肉发育有关的差异表达基因的表达水平进行检测，并与转录组数据进行比较分析。基于全基因组11 577 846个SNPs位点的PCA分析发现M系和B系鸽各自形成独立的一类，滑窗Fst和pFst分析筛选到29个与肌肉发育有关的基因。转录组分析筛选到28日龄乳鸽的胸肌差异表达基因共192个，包含68个上调基因和124个下调基因，差异表达基因主要富集在细胞核组分、细胞凋亡通路、Foxo信号通路、PI3K-Akt信号通路。全基因组和转录组联合分析共筛选到4个基因，其中LTBP1、DPP4和TNFSF10与肌肉发育有关，为解析乳鸽胸肌率差异提供了数据基础。9个差异表达基因的荧光定量PCR表达水平检测结果与转录组基因表达数据间的相关系数为0.50~0.95，表明有较高的相关性。本研究通过联合分析全基因组和转录组数据，揭示了与乳鸽胸肌率差异相关的候选基因，为研究鸽子胸肌发育的分子机制提供了新的视角。

来源：2025年第11期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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