畜牧兽医学报

作者：曹雨, 周铂涵, 许琦, 袁子翱, 苏蕊, 吕琦, 李金泉, 张燕军, 王瑞军, 王志英

单位：1. 内蒙古农业大学动物科学学院, 呼和浩特 010018；2. 农业农村部肉羊遗传育种重点实验室, 呼和浩特 010018；3. 内蒙古自治区羊遗传育种与繁殖重点实验室, 呼和浩特 010018

关键词：eQTL,GWAS,功能基因位点,动物育种

基金：2030科技创新-重大项目(2023ZD0405102)；内蒙古自治区科技计划(2023KYPT0021)；内蒙古自治区教育厅一流学科科研专项重点项目(YLXKZX-NND-007)；2024鄂尔多斯市标志性创新团队(TD20240001)；财政部和农业农村部: 国家绒毛用羊产业技术体系(CARS-39)；羊遗传资源保护与创新利用(BR251201)

精准识别与动物经济性状显著相关的潜在功能基因位点，对提升动物个体育种效果和改良生产性能具有重要的理论与实践意义。随着组学技术的发展，整合多组学数据已成为提高基因鉴定准确性的有效策略。其中，表达数量性状基因座(expression quantitative trait locus, eQTL)分析为解析基因型与经济性状的关联机制以及基因表达的遗传调控网络提供了新的研究视角，使其成为后全基因组关联分析(post-genome-wide association studies, Post-GWAS)时代的重要研究方向。本文首先介绍了eQTL分析的基本原理与方法，然后重点探讨了整合eQTL与GWAS数据提升功能基因位点鉴定效率的策略与方法及其在重要家畜(牛、猪、鸡、羊)遗传育种方面的应用。最后归纳总结了在应用过程中存在的问题，为深入解析动物复杂性状的遗传机制提供了理论依据，同时为推进动物生物育种技术创新、助力种业振兴奠定了重要基础。

来源：2025年第10期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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