国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:马荆鄂, 万书星, 雷文静, 章英枝, 俞梓萱, 刘梓阁, 许继国
单位:1. 南昌师范学院生物技术研究院,南昌 330032;2. 家禽遗传改良江西省重点实验室,南昌 330032
关键词:康乐黄鸡,SNP,全基因组关联分析,体重性状,候选基因,基因通路
基金:国家重点研发计划(2024YFD1300901);江西省高等学校教学改革研究重点课题(JXJG-23-23-5);南昌师范学院学生科研项目(24XSKY91)
旨在挖掘康乐黄鸡16周龄体重相关功能基因及关键信号通路,以期为地方鸡种出栏体重性状的选种选育提供依据。本研究以434只康乐黄鸡为研究对象,采用“京芯1号”55K SNP芯片对康乐黄16周龄体重进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),筛选显著关联SNP(single nucleotide polymorphism)位点。共检测到13个显著关联SNPs,分别位于3号染色体(81 641 565 bp)、4号染色体(1 860 041、33 409 710、33 716 131、33 925 946 bp)、6号染色体(23 563 123、35 324 210 bp)、11号染色体(15 294 113、15 346 007 bp)、12号染色体(2 503 065、2 504 749 bp)以及18号染色体(1 994 686、2 307 607 bp),筛选到825个候选基因。基因功能注释结果表明,运动活动过程为最显著富集的生物学过程,细胞间紧密连接、糖胺聚糖降解和新陈代谢途径等17个通路为显著性富集通路(P < 0.05)。结合前期转录组测序数据、文献综述,初步确定KCNQ5、P2RY10、ITM2A、RBPMS、PGAM1、CYP17A1、BNIP3、ATMIN、BCO1、TNNC1、GNAI2、MYH1F、MYH1A、MYH10、PIK3R5可作为康乐黄鸡16周龄体重的重要候选基因。神经活性配体-受体相互作用信号通路、新陈代谢途径信号通路、心肌细胞肾上腺素能信号传导通路和细胞间紧密连接信号通路为关键通路。本研究初步确定13个SNPs、15个关键候选基因以及4条关键通路与康乐黄鸡16周龄体重显著关联,这些结果为康乐黄鸡生长性状的分子标记辅助育种提供理论依据和技术支撑。
来源:2025年第10期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部