畜牧兽医学报

作者：郭军, 邵丹, 马猛, 卢建, 窦套存, 胡玉萍, 王星果, 王强, 李永峰, 郭伟, 童海兵, 曲亮

单位：江苏省家禽科学研究所，扬州 225125

关键词：开产体重,开产日龄,遗传力,全基因组关联分析,GO富集分析

基金：江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS[2021]104)；国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-40-K01)；科技创新2030—重大项目(2023ZD04052)；国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-40-S23)

针对蛋鸡开产性状进行遗传评估，旨在解析开产体重、开产日龄遗传结构。表型数据源自东乡绿壳蛋鸡-白来航鸡F2分离群体。以600K基因芯片对1 534只F2代试验鸡进行基因型分型。SNPs数据经质量控制后，进行基因型数据填充。以一步法全基因组关联分析获得开产性状关联的遗传标记。对显著性位点进行基因注释以及GO富集分析，进一步理解这些候选基因的生物学含义。鸡开产体重属于高遗传力性状，遗传力在0.62~0.65之间；开产日龄属于中等偏高遗传力性状，遗传力在0.35与0.42之间；开产体重与开产日龄遗传相关系数为0.24~0.37。鸡1号染色体5-羟色胺受体2A(5-hydroxytryptamine receptor 2A, HTR2A)、钙结合蛋白样39(calcium binding protein 39 like, CAB39L)附近存在与开产体重显著关联的QTL，另有343个支持位点超过基因组显著水平，显著性SNPs分别解释11.74%、9.34%开产体重表型方差；4号染色体筛选到开产体重QTL，候选基因为非SMC凝聚素Ⅰ型复合物G亚基(non-SMC condensin Ⅰ complex subunit G，NCAPG)，可解释5.68%表型方差，附近有89个SNPs超过基因组显著水平阈值；鸡9号染色体G蛋白偶联受体149 (G protein-coupled receptor 149, GPR149)附近存在开产体重QTL，可解释1.33%的表型方差。开产日龄QTL位于5号染色体石蛋白2(stonin 2, STON2)基因附近以及9号染色体Mg2+/Mn2+依赖性蛋白磷酸酶样1(protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L, PPM1L)附近，分别解释1.80%、1.22%表型方差。应用一步法GWAS，在鸡9号染色体物理位置22 Mb附近新发现与开产体重、开产日龄关联的遗传座位，还在5号染色体物理位置40 Mb附近新发现一个开产日龄关联的遗传座位。GO富集分析进一步表明，开产体重表型变异与性腺发育相关，开产日龄表型变异与钙离子转运相关。

来源：2025年第10期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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