畜牧兽医学报

作者：王梦瑶, 张志, 吴春琳, 施志玉, 孙学强, 姚火春, 潘子豪

单位：1. 南京农业大学动物医学院，南京 210095；2. 青岛立见生物科技有限公司，青岛 266000

关键词：奶牛产气荚膜梭菌,分离纯化,全基因组测序,MLST分型,毒力因子,耐药基因,遗传进化

基金：动物病原微生物标准物质研制项目(HYQY22044)

旨在探究我国河北、河南等10个地区奶牛场牛源产气荚膜梭菌分离鉴定类型及5株分离株全基因测序信息。利用PCR、测序等技术对全国规模化奶牛场收集的89份疑似患梭菌病的牛病料进行分离鉴定，结合从NCBI公共数据库中获取的17株牛产气荚膜梭菌基因组，运用生物信息学技术对分离株进行泛基因组，系统发育、毒力基因及耐药基因分析。结果显示：经全基因组测序分析显示，分离菌株基因组大小为2.98~3.19 MB，平均每个基因组含有60个tRNA和2 873个基因编码区(CDS)。MLST(多位点序列分型)显示：本研究分离株与从NCBI下载的17株牛源产气荚膜梭菌菌株信息均属于不同类型，除PAN2309B1CP属于ST777型外，其余4株均属于ST72型。22株牛源产气荚膜梭菌共检测到13种耐药基因，30个毒力因子，其中四环素类耐药基因tetA(P) 携带率最高，为86.3%。泛基因组结果分析显示，本研究5株分离株共含有7 927个基因，核心基因数量为1647(占比21.0%)。核心基因组和plc基因进化树分析显示，PAN2305I2CP、PAN2304V2CP、PAN2404F3CP、PAN2404F4CP均在同一分支，PAN2309B1CP在另一分支。本研究为全国首例对奶牛源产气荚膜梭菌分离鉴定和生物信息学分析，进一步丰富了国内奶牛源产气荚膜梭菌流行株菌株库以及其基因组结构、组成和进化信息。同时对产气荚膜梭菌疾病预防治疗和基因组进一步研究提供参考价值。

来源：2025年第10期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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