畜牧兽医学报

作者：田姣, 龙菊烟, 陈霞, 岑晓丽, 牛熙, 黄世会, 王嘉福, 冉雪琴

单位：1. 贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院 山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室, 贵阳 550025；2. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025

关键词：ENTPD1,3'UTR,SINE,基因表达,香猪

基金：国家自然科学基金(32360810；31960641)；贵州省农委项目([HQDPPI-2022])；贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615)

旨在探究香猪ENTPD1基因3'UTR短散在元件(short interspersed nuclear element, SINE)插入/缺失的群体多态性及对基因表达的影响。本研究以香猪为研究对象，以大白猪为对照，利用PCR技术检测香猪和大白猪群体中ENTPD1基因3'UTR区SINE插入/缺失的群体多态性；利用UCSC、SINE Base、miRNA Base、PITA及RBP suite等数据库及软件分析SINE序列中的功能元件；利用Real-time fluorescence quantitative PCR(RT-qPCR)技术检测6月龄健康香猪不同组织(心、肝、脾、肺、肾)ENTPD1的mRNA水平和不同基因型个体肺组织ENTPD1的mRNA水平，利用Western blotting技术检测不同基因型个体肺组织ENTPD1的蛋白水平。结果显示，香猪ENTPD1 3'UTR存在一个297 bp的SINE多态位点，位于终止密码子下游466 bp后，生物信息学分析发现，该SINE属于Pre0_SS tRNA家族，含有RNA聚合酶Ⅲ启动子、多个RNA结合蛋白和miRNA的结合位点；在香猪和大白猪群体中均检测出3种基因型，即插入(SINE+/+)、缺失(SINE-/-)和杂合(SINE+/-)，香猪群体中缺失(SINE-/-)基因型频率极显著高于大白猪(P < 0.01)，SINE-等位基因频率显著高于大白猪(P < 0.05)，SINE插入/缺失在两个群体中均呈现中度多态性，但仅在香猪群体中符合Hardy-Weinberg平衡。香猪不同组织ENTPD1 mRNA检测显示脾、肺组织中mRNA水平较高。香猪不同基因型肺组织ENTPD1的mRNA和蛋白检测显示，SINE-/-、SINE+/-基因型的mRNA水平极显著高于SINE+/+，SINE-/-基因型蛋白水平极显著高于SINE+/-、SINE+/+。研究结果提示，SINE插入负调控ENTPD1基因的表达。

来源：2025年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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