畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2025年第9期:基于转录组和蛋白质组分析筛选银黑狐毛色形成的关键基因

发布日期:

作者:李佳鹏, 刘庆, 孙佳钰, 马泽芳, 崔凯

单位:青岛农业大学动物科技学院, 青岛 266109

关键词:狐,毛色,转录组,蛋白质组,关键基因

基金:农业部财政项目:北美赤狐等3个品种性能测定和样品采集(19220703);横向课题:改良型蓝狐综合培育技术的开发(6602419022)

旨在筛选影响银黑狐毛色形成的关键基因。在相同饲养条件下,本研究选取9月龄、健康且体重相近的雄性银黑狐和北美赤狐各4只,将其分为银黑狐组(YS)和北美赤狐组(CS)。分别采集两组狐的背中部皮肤样本进行转录组测序(RNA-Seq)和串联质量标签(TMT)标记的定量蛋白质组测序分析,筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达蛋白(DEPs)并进行功能富集分析,鉴定与银黑狐毛色形成相关的候选基因。结果表明,与北美赤狐相比,在银黑狐皮肤中共鉴定到2 403个差异表达基因(DEGs)和203种差异表达蛋白质(DEPs)。功能富集分析显示,15个DEGs和6个DEPs通过黑色素合成、PI3K-Akt、cAMP、Wnt和MAPK信号通路参与调控黑色素生物合成。转录组与蛋白质组关联分析表明,TYRP1和NRAS等12个基因在mRNA和蛋白质表达水平上呈现一致的显著变化。蛋白互作网络分析进一步确认了TYRP1、NRAS、MLANA、LEF1、TYR、KITLG、EDNRB、GSK3β、AKT2和ERBB3基因为黑色素合成的关键基因。RT-qPCR和Western blot验证了测序结果的可靠性。本研究确定TYRP1和NRAS可能是影响银黑狐毛色表型的关键候选基因,为银黑狐毛色形成的分子调控机制及狐的分子育种提供了理论依据。

来源:2025年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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