畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2025年第9期:一株羊冠状病毒的分离鉴定及全基因组序列分析

发布日期:

作者:余秋蓉, 蔡旭航, 何艺, 李基棕, 毛立, 许信刚, 李彬

单位:1. 西北农林科技大学动物医学院, 杨凌 712100;2. 江苏省农业科学院兽医研究所 农业农村部兽用生物制品工程技术重点实验室, 南京 210014;3. 阜康市城关镇农业(畜牧业)发展服务中心, 阜康 831500

关键词:羊冠状病毒,分离鉴定,全基因组测序,进化分析

基金:国家重点研发计划(2023YFD1801302);江苏省重点研发计划(BE2022330);兽医生物技术国家重点实验室开放基金(SKLVBF202106)

冠状病毒在全世界广泛流行,能够引起人和动物呼吸道和消化道疾病,动物感染冠状病毒对养殖业造成巨大经济损失。为进一步丰富我国草食动物冠状病毒的流行病学资料,笔者拟对新疆腹泻山羊样品进行羊冠状病毒(caprine coronavirus,cpCoV)分离研究,并开展生物学特性鉴定。用RT-PCR方法从新疆昌吉某羊场腹泻山羊肛拭子样品中检测到cpCoV阳性,成功分离一株羊冠状病毒,命名为cpCoV/XJCJ2301G。该毒株接种细胞后可观察到明显的细胞病变,IFA试验、RT-PCR检测均为cpCoV阳性,电镜观察可见直径100 nm,周围呈皇冠状的特异病毒颗粒。病毒的遗传演化结果表明,XJCJ2301G株处于β-CoVs Embecovirus分支,与现有羊冠状病毒共同组成独立进化分支,独立于牛冠状病毒的四个亚型。经分析NS4a-NS4b基因序列,发现在两段区域内有75 nt缺失突变,导致非结构蛋白截短或延长。S基因序列比对分析发现,cpCoV与BCoV的差异主要集中于CTD区域。本研究首次从新疆地区分离到的羊冠状病毒,丰富了我国冠状病毒的流行病学资料,其NS4a-NS4b碱基数量在牛、羊和兔冠状病毒之间形成阶梯式依次缺失,提示该毒株可能是动物冠状病毒演化过程中的节点,在草食动物冠状病毒的遗传演化过程中具有重要意义。

来源:2025年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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