畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2025年第8期:A 群猪轮状病毒微滴式数字PCR检测方法的建立及其应用

发布日期:

作者:陈冰冰, 蔡蔚游, 刘玉彤, 王修武, 孙守湖, 贺东生

单位:1. 华南农业大学兽医学院, 广州 510642;2. 汕头市澄海区动物疫病预防控制中心, 汕头 515800;3. 岭南现代农业科学与技术广东省实验室肇庆分中心, 肇庆 526238

关键词:A群猪轮状病毒,微滴式数字PCR,检测方法

基金:岭南现代农业科学与技术广东省实验室肇庆分中心项目(P20211154-0302)

旨在建立一种特异、灵敏的A 群猪轮状病毒(porcine rotavirus A, PoRVA)微滴式数字PCR(ddPCR)新型检测方法。本研究根据GenBank中PoRVA的VP6基因保守序列,设计猪轮状病毒特异性引物和探针,优化其反应条件,从而构建PoRVA的ddPCR检测方法,并测定其特异性、灵敏度、重复性以及临床样品试验。优化反应条件结果显示,最佳引物浓度为600 nmol·L-1,最佳探针浓度为300 nmol·L-1;退火温度在56 ℃时,病毒阳性液滴拷贝数最高;特异性结果显示,自行建立的检测方法仅能检出PoRVA,而猪丁型冠状病毒、猪流行性腹泻病毒等七种对照病毒核酸检测结果均为阴性;灵敏度结果显示,该方法最低检测限度为3.97 copies·μL-1,比普通PCR(最低检测限度3 970 copies·μL-1)和荧光定量PCR(最低检测限度39.7 copies·μL-1)分别高1 000倍和10倍;重复性结果显示,组内和组间变异系数小于10%;对142份临床样品检测显示,ddPCR检出阳性率高于qPCR和PCR。综上,本研究自行建立的PoRVA ddPCR新型检测方法特异性强、灵敏度高、重复性好,适用于猪轮状病毒早期感染诊断和流行病学调查,可为日后持续性监控猪轮状疫情提供可靠的手段。

来源:2025年第8期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2025年第8期

联系我们

  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 电话:010-62815987
  • E-mail:xmsyxb@caas.cn

咨询工作人员