畜牧兽医学报

作者：张嘉良, 黄畅, 杨永林, 杨华, 白文林, 马月辉, 赵倩君

单位：1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193；2. 新疆农垦科学院，石河子 832000；3. 沈阳农业大学，沈阳 110000

关键词：绵羊,SNP芯片,群体遗传结构,选择信号

基金：国家重点研发计划“绵羊新品种新品系培育及良繁”(2021YFD1300901)；国家绒毛用羊产业技术体系项目(CARS-39-01)

旨在揭示不同被毛类型绵羊群体的遗传结构特征，通过选择信号分析筛选与羊毛性状相关的候选基因。本研究选择8个绵羊群体(包括15只欧拉羊、13只塔什库尔干羊、15只阿勒泰羊、16只藏绵羊、12只青海毛肉兼用细毛羊、10只甘肃高山细毛羊、15只中国美利奴羊和11只敖汉细毛羊)共计107只个体作为研究对象。将绵羊群体按照不同羊毛类型分为两组，包括59只细毛型绵羊和48只粗毛型绵羊。使用自主研发的绵羊SNP 50K液相芯片对所选绵羊群体进行基因分型，经质控后进行主成分分析、邻接连接树和群体遗传结构分析。基于群体遗传分化指数(FST)和核苷酸多样性比值(θπ ratio)两种选择信号方法筛选与羊毛性状相关的候选基因，通过KEGG通路分析确定候选基因的功能。主成分分析、邻接连接树和群体遗传结构分析的结果表明，两组绵羊群体之间存在遗传分化。基于FST和θπ Ratio的结合分析，前1%区域作为受选择区域，检测到165个受选择区域，包含456个受选择基因。基因注释发现，受选择基因与毛囊及毛发发育(JAK2、SELENBP1)、黑色素合成(IRF4)、真皮乳头细胞的间接调控(RAC2)以及皮肤分子生物学中关键管家基因(SDHA)密切相关。本研究探究了8个我国绵羊群体的遗传结构, 细毛型和粗毛型绵羊群体间有明显的群体分化。基于两种选择信号检测方法筛选到与羊毛性状相关的候选基因(JAK2、IRF4、RAC2、IDUA、SDHA和SELENBP1)等。研究结果可为绵羊羊毛性状的分子遗传标记挖掘提供参考。

来源：2025年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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