国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:刘莎, 苏蒙, 高倩梅, 宋丹丽, 赵桂苹, 李建慧, 李庆贺
单位:1. 山西农业大学, 太谷 030801;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193
关键词:SIRT1,禽巨噬细胞,转录组
基金:抗重大疫病鸡新品种设计与培育(2023ZD0405302)
旨在激活SIRT1,通过转录组测序探究其在家禽巨噬细胞中的免疫调节作用及相关靶基因和信号通路。本试验用SIRT1的一种选择性激活剂:SRT1720 HCl 1 μmol·L-1处理鸡巨噬细胞,试验分为对照组(DMSO)和试验组(SRT1720 HCl),每组5个生物学重复,处理24 h后通过提取细胞总RNA反转录,使用Illumina Novaseq X Plus进行高通量测序,利用生物信息学方法进行分析。以|log2FC|>1和校正后的P < 0.05为阈值筛选差异表达基因,共筛选到1 183个差异表达表达基因(P < 0.05),其中781个基因表达上调,402个基因表达下调,包括CD14、TLR7、IL10RA、NFKBIA和JUN等重要基因。从差异表达基因中选取5个基因进行实时荧光定量验证,结果与转录组结果一致。对筛选到的差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析,GO分析显著富集到代谢过程、免疫系统过程、生物粘附和催化活性等GO条目(P < 0.05);KEGG分析显著富集到MAPK信号通路、TOLL样受体信号通路和NOD样受体信号通路等,值得注意的是分析富集到了沙门氏菌感染信号通路,提示激活禽巨噬细胞SIRT1后可能影响感染沙门氏菌;通过构建蛋白互作网络发现SIRT1可能与NFKBIA、JUN等基因关系密切。本研究利用SIRT1基因激活后鸡巨噬细胞转录组分析筛选到与免疫相关的基因和重要通路,为探究SIRT1在家禽免疫中的作用提供研究基础。
来源:2025年第6期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部