畜牧兽医学报

作者：石闪闪, 万琼飞, 许赢心, 王秋硕, 张林林, 郭益文, 胡德宝, 郭宏, 丁向彬, 李新

单位：天津农学院动物科学与动物医学学院, 天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室, 天津 300384

关键词：牛,骨骼肌发育,miRNA测序,靶基因预测

基金：国家自然科学基金(31501939)；天津市自然科学基金(16JCZDJC33300)；天津市中央引导地方科技发展资金优秀农业科技特派员项目(23ZYCGSN00400)

为明确牛骨骼肌不同发育阶段miRNA表达情况，筛选影响牛骨骼肌发育的关键miRNA。本研究利用胚胎切割和胚胎移植技术获得的来源相同、遗传背景高度一致的3月龄、6月龄胚胎肌肉组织和9月龄胎儿肌肉组织进行RNA-seq测序分析，运用生物信息学筛选差异表达的miRNA，并进行靶基因预测和功能富集分析。6月龄vs.3月龄、9月龄vs.6月龄、9月龄vs.3月龄分别筛选出262个(上调130个，下调132个)、397个(上调199个，下调198个)、448个(上调224个，下调224个)差异表达miRNA，同时分别预测到靶基因3 854个、7 434个、8 167个。对这些靶基因进行功能注释及信号通路分析，发现6月龄vs.3月龄差异表达miRNA靶基因主要参与肌肉细胞中的细胞骨架、焦点粘连以及动物自噬等5条与肌肉发育相关通路；9月龄vs. 6月龄差异表达miRNA靶基因主要参与肌肉细胞中的细胞骨架、焦点粘连以及生长激素的合成、分泌和作用等4条与肌肉发育相关通路；9月龄vs.3月龄差异表达miRNA靶基因主要参与肌肉细胞中的细胞骨架、焦点粘连以及肌动蛋白细胞骨架的调节等6条与肌肉发育相关通路；构建差异表达miRNAs与骨骼肌发育相关功能靶基因的调控网络图，发现其中bta-miR-139、bta-miR-499、bta-miR-7、bta-miR-148a、bta-miR-204等38个miRNA可能在牛不同时期骨骼肌生长发育中起调控作用。本研究结果为深入理解牛骨骼肌发育的分子机制提供重要的理论依据，同时为后续牛骨骼肌miRNA研究提供了基础资料。

来源：2025年第6期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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