畜牧兽医学报

作者：杨杨, 李良远, 万鹏程, 卢守亮, 刘长彬, 杨华, 王立民, 代蓉, 周平

单位：1. 新疆农垦科学院, 省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室, 石河子 832000；2. 贵州中医药大学中药民族药资源研究院, 贵阳 550025

关键词：绵羊,季节性发情,RNA-seq,核心基因,lncRNA

基金：兵团重点领域科技攻关项目; 兵团农业创新工程(NCG202221);中央引导地方科技发展资金项目; 省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室建设(2022CA002)

旨在筛选与季节性发情相关的核心基因和长链非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)。本研究选取2~3岁空怀的中国美利奴羊和湖羊母羊(乏情期、发情期和发情间期各3只)，采集卵巢组织样本，采用RNA-seq技术筛选差异表达的基因(differentially expressed genes, DEGs)和lncRNAs，并通过GO、KEGG富集分析、PPI分析及ceRNA网络构建鉴定与繁殖性能相关的核心基因和lncRNAs。结果，构建了6个不同生理状态下的RNA文库，筛选得到1 495个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)和454个差异表达lncRNAs，其中共性DEGs和lncRNAs分别为313个和435个，特有DEGs和lncRNAs分别为1 182个和19个。GO和KEGG富集分析显示，共性DEGs在细胞分裂和细胞周期等方面显著富集，而差异表达的lncRNAs靶基因富集于细胞内信号转导及负调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录等。特有DEGs在细胞迁移的正向调节中富集，lncRNAs的靶基因集中于细胞间粘附和整合素介导的信号通路等。通过PPI筛选出19个核心基因，主要富集在卵母细胞减数分裂和细胞周期信号通路。聚类分析结果显示，核心基因在乏情期表达量较高。ceRNA网络进一步揭示基因在细胞周期等信号通路的富集。RT-qPCR验证结果与高通量测序一致。筛选出19个核心基因和28个lncRNAs，并发现42个lncRNA-miRNA-mRNA靶向关系，为理解绵羊季节性繁殖的分子机制提供了潜在调控靶点。

来源：2025年第3期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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