畜牧兽医学报

作者：万伟粲, 何旭, 刘洋, 马玉勇, 蒋玉章, 戴求仲, 燕海峰, 蒋桂韬, 李闯

单位：1. 湖南省畜牧兽医研究所, 长沙 410131；2. 衡阳市农业科学院, 衡阳 421101；3. 道县畜牧水产事务中心, 永州 425300

关键词：重测序,道州灰鹅,遗传结构

基金：湖南省家禽产业技术体系(湘农函[2023]67号)；国家重点研发计划项目(2021YFD120030102)

旨在研究道州灰鹅保种场鹅群的遗传结构、遗传多样性和亲缘关系，为后续道州灰鹅的保种工作提供参考。道州灰鹅保种场采用单父本家系轮配的保种模式进行保种，共49个家系，每个家系中取一只200日龄左右的健康公鹅，采静脉血进行DNA抽提，对DNA样品进行全基因组重测序，根据每个家系公鹅的重测序数据，利用生物信息学软件对群体遗传结构和遗传多样性进行分析与评价。结果，共检测到道州灰鹅保种群体的SNPs位点15 245 050个，在过滤质控后得到SNPs位点14 628 485个。群体遗传多样性分析结果显示，群体的平均观测杂合度(Ho)为0.280，平均期望杂合度(He)为0.288，群体近亲系数(Fis)为0.070，平均多态信息含量(PIC)为0.262，基因多样性指数(Nei)为0.331。道州灰鹅保种群体共检测到802个连续纯合片段(ROH)，基于ROH值计算得出的近交系数为0.010，近交程度较低。IBS距离矩阵、G矩阵的结果相似，只有少部分的个体间亲缘关系较近。群体渗透分析与主成分分析结果同样显示，大部分个体聚类为一个亚群，少部分个体聚类为2个小亚群。通过群体分化指数(Fst)的计算结果，2个小的亚群之间出现了中等程度的分化。总体而言，道州灰鹅保种群体的遗传多样性较为丰富，近交水平较低，保种效果优良，建议减少亲缘关系过于接近的家系间的配种，以保持遗传多样性和群体的长期健康。

来源：2025年第2期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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