国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:吴双, 尹娜, 余莫涵, 平玉宇, 白皓, 陈世豪, 常国斌
单位:1. 扬州大学动物科学与技术学院, 扬州 225009;2. 扬州大学兽医学院, 扬州 225009
关键词:TRIM39.2,鸡巨噬细胞,转录组,GO,KEGG
基金:国家自然科学基金(32002271);国家肉鸡产业技术体系(CARS-41)
旨在探究鸡主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)定位的TRIM39.2过表达对鸡巨噬细胞转录表达谱的影响。本研究通过RT-qPCR构建鸡TRIM39.2基因组织表达谱,克隆鸡TRIM39.2基因并构建携带标签的重组表达载体。分别转染空载体和TRIM39.2真核表达载体至HD11细胞内,收获RNA制备文库并进行转录组测序及生物信息学分析。筛选差异表达基因,随后进行GO和KEGG富集分析,并用RT-qPCR方法进一步验证转录组测序结果。结果表明,与其他组织相比,脾脏中TRIM39.2的表达最高。成功克隆了鸡TRIM39.2基因,并构建了携带Myc标签的重组表达载体pCAGGS-Myc-TRIM39.2,并验证了重组载体成功在鸡HD11细胞中表达TRIM39.2重组蛋白。转录组测序分析获得了33个显著差异表达基因。GO分析主要富集于细胞因子的活性特性及其参与介导的信号传导途径。KEGG分析则主要富集于细胞因子与受体间的相互作用及RIG-I样受体信号等通路。鸡TRIM39.2基因在巨噬细胞介导的免疫应答和信号传导中具有重要的调控作用,尤其对RIG-I样受体介导的I型干扰素信号通路具有正调控作用,本研究为进一步丰富鸡RIG-I样受体信号通路调控网络奠定基础。
来源:2025年第1期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部