畜牧兽医学报

作者：牛一凡, 李崇阳, 张培培, 张航, 冯肖艺, 余洲, 曹建华, 杜卫华, 万鹏程, 马友记, 赵学明

单位：1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193；2. 甘肃农业大学动物科学技术学院, 兰州 730070；3. 新疆农垦科学院畜牧兽医研究所, 石河子 832000

关键词：华西牛,活检胚胎,扩增体系,效果比较

基金：国家重点研发计划政府间重点专项(2022YFE0100200)；国家自然科学基金国际合作项目(32161143032)；农业农村部和财政部资助：现代农业产业技术体系资助(CARS-36)；国家家养动物种质资源库；中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS06)

旨在通过二代测序技术评估不同单细胞全基因组扩增体系对不同数量胚胎细胞的扩增效率。本研究选择同一饲养管理条件下、体况良好的华西牛母牛为供体，采用FSH法超数排卵后进行人工授收集第7天胚胎，通过活检技术获得含1细胞(cell，1C)、5C、10C胚胎细胞样本用于全基因组扩增(whole genome amplification)，随后通过全基因组重测序(whole genome sequencing)技术评估单细胞基因组扩增体系扩增效率的差异。结果显示，在1C和5C样本中多重置换扩增(multiple displacement amplification，MDA)体系的扩增成功率优于多次退火环状循环扩增(multiple annealing and looping-based amplification cycles，MALBAC)体系(100% vs. 60%，100% vs. 80%，P < 0.05)，此外MDA体系的扩增产物总量极显著高于MALBAC体系(P < 0.01)；基于测序分析指标：正确比对率、重复率、分型一致率、等位基因缺失率、假阳性率等，MALBAC体系优于MDA体系；全同胞样品的分型一致率大于半同胞样品的分型一致率，但不同全同胞、半同胞胚胎样本之间的分型一致率有很大差异。综上所述，MDA和MALBAC体系各具特点，结合两者优势可能是改进扩增效率的途径之一，本研究为牛早期胚胎全基因组选择研究和促进牛育种发展提供一定理论基础。

来源：2025年第1期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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