畜牧兽医学报

作者：程昕琰, 王诗媛, 吉叶标, 黄思秀, 杨杰, 孟繁明, 张茂, 蔡更元, 刘琅青

单位：1. 华南农业大学动物科学学院, 国家生猪种业工程技术研究中心, 广州 510642；2. 广东省农业科学院动物科学研究所, 猪禽种业全国重点实验室, 广东省畜禽育种与营养研究重点实验室, 广州 510640；3. 清远龙发种猪有限公司, 广东省生猪育种工程技术研究中心, 英德 513057；4. 韶关学院生物与农业学院, 韶关 512000

关键词：华南地方猪,SNP芯片,保种,遗传多样性,群体遗传结构

基金：广东省乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-XJS-00-002);广东省普通高校重点领域专项(2021ZDZX4040);清远市创新创业研究团队项目(2018002)

旨在揭示广东省4类重点保护地方猪种的保种情况，评估其保种群体的遗传结构信息，辅助保护和利用地方猪种质资源。本研究采用2023年采集自6个保种场的广东省4类地方猪共488头(新丰板岭大花白猪92头、新丰板岭蓝塘猪34头、紫金东瑞蓝塘猪68头、乐家庄小耳花猪77头、壹号食品小耳花猪109头、北礤粤东黑猪108头)。使用50K SNP芯片对比了包括欧洲野猪、瘦肉型猪、其他华南地方猪以及其他中国地方猪在内的41个地方猪品种，共2 144头。质控后保留20 590个SNPs位点。对广东4类地方猪种保种群体进行遗传多样性、血缘纯度、亲缘关系以及家系结构分析。结果显示：新丰板岭大花白猪的近交系数(F值)为0.409，观测杂合度(Ho)为0.181，期望杂合度(He)为0.172，连续纯和片段(ROH)长度为475.81 Mb，连锁不平衡(LD)长度为467.88 kb，平均FROH值为0.212，保种场内分为5个家系；新丰板岭蓝塘猪的F值为0.316，Ho为0.210，He为0.189，ROH长度为441.76 Mb，LD长度为475.78 kb，FROH值为0.201，分为4个家系；紫金东瑞蓝塘猪的F值为0.239，Ho为0.233，He为0.218，ROH长度为224.13 Mb，LD长度为463.53 kb，FROH值为0.100，分为5个家系；乐家庄小耳花猪的F值为0.319，Ho为0.208，He为0.221，ROH长度为262.62 Mb，LD长度为460.88 kb，FROH值为0.117，分为7个家系；壹号小耳花猪的F值为0.435，Ho为0.173，He为0.171，ROH长度为113.41 Mb，LD长度为418.59 kb，FROH值为0.051，分为6个家系；北礤粤东黑猪的F值为-0.028，Ho为0.314，He为0.300，ROH长度为247.47 Mb，LD长度为467.88 kb，FROH值为0.110，分为5个家系。对各保种群体血缘组成进行分析，除粤东黑猪群体血缘仍大量受瘦肉型猪血缘影响，平均中国猪血缘比例为69.37%，其他4个群体均受瘦肉型群体血缘影响较小，血缘较纯，平均中国猪血缘比例大于90%，保种情况较好。综上，广东省各地方猪保种场后期应加强对地方猪的扩繁和选育工作，在保持血缘纯度稳定的情况下，降低近交程度。

来源：2024年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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