畜牧兽医学报

作者：李聪, 刘书琴, 高峰, 苏江天, 王朝飞, 拓少华, 孙玉江, 党瑞华

单位：1. 西北农林科技大学动物科技学院, 杨凌 712100；2. 青岛农业大学动物科技学院, 青岛 266109；3. 延安市安塞区科学技术局, 延安 717400

关键词：家驴,靶向测序基因型检测,液相芯片,育种

基金：山东省农业重大应用技术创新项目(SD2019XM008);山东省现代农业产业技术体系驴创新团队建设专项基金(SDAIT-27);中央引导地方项目(K3030922098);陕西省创新能力支持计划项目(2018XY-021);陕西省科技厅“科学家+工程师”项目(2020)

为加快我国家驴的分子选育进展，本研究收集国内外27个驴品种，共251头成年驴的全基因组重测序数据，结合国内外家驴重要性状遗传变异研究结果，设计了一款基于靶向测序基因型检测技术的家驴40K液相芯片。结果表明，家驴40K液相芯片中的变异位点(45 893个SNPs和1个InDel)在家驴基因组范围内的平均间距为61.8 kb。利用该芯片对210头成年德州驴母驴进行基因分型测试，所有测试样本的位点检出率为98.4%~99.2%，位点平均测序深度为133×，共有42 575个位点的次等位基因频率大于0.35。使用芯片对20张驴皮样本进行了品种鉴定，初步验证了芯片的可用性。综上，本研究开发的家驴40K液相芯片作为首款大规模家驴基因型检测工具，具有位点密度高、多态性好、检出率高、应用性强等优势，可用于家驴早期的分子标记辅助选择、品种鉴定等方面，进一步提高家驴的育种效率。

来源：2024年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2024年第12期