畜牧兽医学报

作者：闵祥玉, 卫佳丽, 许彪, 刘汇涛, 郑军军, 王桂武

单位：中国农业科学院特产研究所, 长春 130112

关键词：梅花鹿鹿茸,全长转录组测序,产茸性状,功能基因,差异分析

基金：吉林省农业关键核心技术示范推广(产业技术体系)项目(JARS-2024-0801-04);吉林省畜禽遗传资源开发利用及科技提质增效项目(202404-4);吉林省自然科学基金(YDZJ202201ZYTS463)

旨在获得梅花鹿鹿茸组织全长转录本和结构信息，并进一步挖掘出影响梅花鹿鹿茸产量的功能基因。本研究采取饲养管理条件一致的6头2锯龄健康雄性东大梅花鹿，取其相同部位鹿茸组织。根据茸重将鹿茸分为高、低产两组，每组3个重复。利用PacBio Sequel平台以及Illumina平台分别对高、低产鹿茸混合样品进行全长转录组测序。结合高、低产两组二代测序技术，使用SUPPA、KOBOS-I、Cytoscape等工具对可变剪接、功能富集及Hub基因等预测分析。高、低产组测序分别获得有效插入片段36 074 385 bp和32 413 962 bp；转录因子注释显示高产组中bHLH家族转录本数量要高于TF_bZIP家族，低产组中则相反。高产鹿茸组共存在6 644个可变剪接事件，而低产鹿茸组则为7 626个可变剪接事件；经比对，COL1A1在多个融合基因中起主效作用；两组样品中共筛选出207个差异表达基因，KEGG富集显示差异表达基因主要集中在甲状旁腺激素的合成、分泌以及胆固醇代谢等通路；鉴定到11个Hub基因，分别是APOB、SH3GL2、SYT1、ANGPTL4、FGF21、CACNA1E、SERPINF2、CACNB4、KLK4、LRP2、KCNA1。本研究结果为进一步的功能基因鉴定工作和分子育种策略的发展提供了新的理论基础和研究路径。

来源：2024年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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