畜牧兽医学报

作者：梁慧丽, 解玉静, 司博文, 王桂英, 姜运良, 曹贵玲

单位：1. 聊城大学农业与生物学院, 聊城 252000；2. 山东农业大学 山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室, 泰安 201718

关键词：大尾寒羊,全基因组重测序,基因组变异,群体结构

基金：山东省自然科学基金(ZR2021MC130);山东省农业良种工程(2019LZGC019)

旨在了解大尾寒羊基因组遗传变异特征和群体结构，可以为更好地保护和利用大尾寒羊提供指导。本研究对170只(66只公羊，104只母羊)大尾寒羊进行了全基因组重测序，利用GATK、Manta、Plink等软件对大尾寒羊基因组遗传变异、群体结构和连锁不平衡等进行了分析，以期了解大尾寒羊基因组变异特征和群体结构。测序共获得1 599.56 G高质量数据(平均9.409 G·只-1)。大尾寒羊群体中共发现50 276 079个SNPs和7 240 540个InDel，它们多分布于基因间和内含子区域。群体的基因组结构性变异(SV)最多的类型为染色体间的易位(CTX)，平均每只羊有415.82个CTX，主要分布在基因间区域；发生拷贝数变异(CNV)最多的区域在外显子，平均每只羊有175个。主成分分析显示, 大尾寒羊个体较分散，聚集不集中。结合亲缘关系、系统发育树和群体结构，将大尾寒羊分为6个家系，各家系含量差别较大，体型有差异。群体聚类分析中发现有些个体祖先成分较为单一。群体连锁不平衡(LD)分析显示LD衰减速度快，群体遗传多样性较高。驯化中受选择的基因主要与脂质代谢和产热有关。综上，大尾寒羊群体包含6个家系，遗传多样性较丰富，保种效果良好，建议对小家系进行扩繁，大家系注意减少近交，确保家系结构平衡，同时注重大尾寒羊的开发和利用。

来源：2024年第11期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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