畜牧兽医学报

作者：周蜓蜓, 李立, 吴燕涛, 逯文颖, 付宝权, 殷宏, 贾万忠, 闫鸿斌

单位：1. 中国农业科学院兰州兽医研究所, 兰州大学动物医学与生物安全学院, 动物疫病防控全国重点实验室, 国家动物包虫病专业实验室, 甘肃省病原生物学基础学科研究中心, 甘肃省动物寄生虫病重点实验室, 农业农村部动物病原生物学重点实验室, 农业农村部反刍动物重大疫病防控重点实验室(西部), 兰州 730000；2. 江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心, 扬州 225009

关键词：单细胞测序,转录组,数据分析,寄生虫病

基金：国家重点研发计划(2022YFD1800200);甘肃省科技重大专项(23ZDNA007);甘肃省科技重大专项(22ZD6NA001);甘肃省在站博士后专项(23JRRA558);国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37);兰州大学中央高校基本科研业务费专项资金(lzujbky-2024-ydyl02);动物疫病防控全国重点实验室重大成果培育项目(SKLADCP2023HP05);中国农业科学院创新工程(CAASTIP-2024-5);中国农业科学院创新工程(CAAS-ASTIP-2021-

单细胞转录组代表了某一时刻单个细胞内所有mRNA总表达量，其表达量反映该细胞的总体特征。通过单细胞转录组测序(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序，测序结果中包含的大量信息有可能重塑对发育生物学、基因调控以及健康和疾病中细胞异质性的理解。随着科学技术的不断发展，测序技术也在不断进步，scRNA-seq全方位、高通量以及高分辨率的特点可构建更细致、全面和精准的单细胞图谱。本文综述了常用scRNA-seq方法及其数据分析主要流程和单细胞转录组学技术在寄生虫学与寄生虫病领域研究中的应用，以期为该领域相关研究提供参考资料。

来源：2024年第10期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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