国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:张寅梁, 张冉, 王文君, 王德贺, 李兰会, 周荣艳
单位:河北农业大学动物科技学院, 保定 071001
关键词:蛋鸡,转录组,差异表达基因,生理阶段,胫骨,骨代谢
基金:国家自然科学基金项目(32272922);河北省重点研发计划项目现代种业科技创新专项(22326319D);河北省鸡现代种业科技创新团队(21326303D);河北省现代农业产业技术体系建设专项资金(HBCT2024260204)
旨在挖掘影响蛋鸡产蛋前后骨代谢差异的调控通路和关键候选基因,为进一步研究维持蛋鸡骨骼健康的调控机制提供理论依据。本研究选择15只15周龄和12只22周龄体重相近饲养条件相同的海兰灰蛋鸡,采集血液和胫骨,测定血浆钙、磷、雌激素、骨代谢相关生化指标,根据雌激素水平选择每组各6只的胫骨组织构建12个转录组文库并筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO功能和KEGG富集分析。随机选择6个差异表达基因,利用qRT-PCR验证其相对表达量。15周龄与22周龄相比,蛋鸡血浆骨代谢标记物和雌激素水平均呈现显著变化(P<0.05)。构建的12个胫骨cDNA文库中得到40 082 240~186 154 554条有效碱基序列数,Q30值最少为92.18%,比对率在76.52%~90.55%之间。对15周龄与22周龄胫骨转录组进行比较,鉴定出1 832个差异表达基因,其中914个基因下调,918个基因上调。GO功能注释发现,差异表达基因主要显著富集在蛋白加工、对内质网应激的反应和胶原原纤维组织等过程。KEGG富集分析发现,与骨代谢相关的显著富集通路有类固醇生物合成、甲状腺激素合成、TGF-β信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路,筛选出18个这些通路共有的基因作为调控骨代谢的关键候选基因。本研究揭示了产蛋前后蛋鸡胫骨组织中基因表达存在差异,筛选到多个影响骨代谢的差异表达基因和通路,为进一步研究蛋鸡产蛋前后骨代谢转换机制提供理论依据。
来源:2024年第10期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部