畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2024年第9期:基于Smart-seq2探究玻璃化冷冻对猪孤雌激活囊胚基因表达的影响

发布日期:

作者:杨柏高, 龙熙, 张亮, 徐皆欢, 戴建军, 赵学明, 潘红梅

单位:1. 重庆市畜牧科学院,重庆 402460;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193;3. 上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海 201106

关键词:Smart-seq2,玻璃化冷冻,猪,孤雌激活,囊胚

基金:重庆市技术创新与应用发展专项重点项目(cstc2021jscx-dxwtBX0004);重庆地方猪胚胎冷冻保存技术研究与猪育种新材料创制(2022-CHQ-01-01);重庆市人民政府与中国农业科学院战略合作资助项目(23310)

旨在探究玻璃化冷冻对猪孤雌激活(parthenogenetic activation, PA)囊胚基因表达的影响。本研究以猪PA囊胚为研究对象,根据试验处理分为新鲜组、玻璃化冷冻组Ⅰ和玻璃化冷冻组Ⅱ,随后从每组挑选3枚形态良好的囊胚,利用Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术进行转录组测序分析。结果显示,玻璃化冷冻组Ⅰ与新鲜组相比,共鉴定到772个差异表达基因(differential expression genes,DEGs),GO和KEGG富集分析结果显示,这些DEGs与细胞脂质代谢过程、细胞葡萄糖稳态、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等相关;玻璃化冷冻组Ⅱ与新鲜组相比,共鉴定到1 613个DEGs,主要与糖异生、代谢途径、氨基酸生物合成等相关;玻璃化冷冻组Ⅱ与玻璃化冷冻组Ⅰ相比,鉴定到822个DEGs,主要与丙酮酸代谢过程、N-聚糖生物合成、细胞衰老等相关。综上,本研究基于Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术揭示了玻璃化冷冻对猪PA囊胚脂质代谢、能量代谢、MAPK信号通路等相关基因表达的影响。

来源:2024年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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