畜牧兽医学报

作者：陈静, 吴薛蓓, 苗冬枝, 张弛, 郭振玉, 王莹

单位：扬州大学动物科学与技术学院，扬州 225009

关键词：鸽,产蛋间隔,卵泡发育,转录组

基金：国家自然科学基金(32372875);江苏高校优势学科建设工程四期项目(PAPD)

旨在对产蛋间隔前期母鸽卵泡颗粒细胞(GC)层进行高通量测序，筛选出与鸽卵泡发育和选择相关的关键基因。本研究选择了80对12月龄产蛋规律、体重相近的白羽王鸽为研究对象，在产蛋间隔第1天(LI1)和第3天(LI3)分别选择3只母鸽，采集F1和SF1卵泡GC层，并利用RNA-seq进行转录组分析，筛选L1F1/L1SF1、L3F1/L3SF1、L1F1/L3F1和L1SF1/L3SF1组，4组间差异表达基因(DEGs)，对DEGs进行GO功能注释和KEGG通路富集分析，通过STRING数据库进行蛋白质互作(PPI)网络分析并使用Cytoscape软件进行可视化处理筛选关键基因，各组随机选择5个DEGs进行RT-qPCR验证转录组的可靠性。在4组比对中分别获得77、2 736、5 698和3 864个DEGs。GO分析显示，4组DEGs都主要富集的GO条目为细胞过程、细胞解剖实体和连接。KEGG通路富集分析显示，L1F1/L1SF1组和L3F1/L3SF1组DEGs均显著富集在类固醇激素生物合成和卵巢类固醇合成等信号通路，L1F1/L3F1组和L1SF1/L3SF1组DEGs均显著富集在糖胺聚糖降解、突触囊泡周期和氧化磷酸化等信号通路。进一步地，进行PPI网络分析并筛选与卵泡发育和选择密切相关的DEGs。各组随机选择5个DEGs进行RT-qPCR验证，表达趋势与测序结果一致。本研究利用RNA-seq技术筛选到与鸽卵泡发育和选择相关的关键基因——EEF2、DDX5、PLK2、IGF2R、LHCGR、HSD3B1、CYP19A1和StAR，为进一步探究鸽卵泡发育和选择的分子调控机制提供了理论依据。

来源：2024年第8期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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