畜牧兽医学报

作者：王婷, 张元庆, 闫益波, 上官明军, 郭宏宇, 王志武

单位：山西农业大学动物科学学院，太原 030031

关键词：群体遗传结构,选择信号分析,欧拉羊(藏系绵羊)

基金：山西省重点研发(2022ZDYF114);山西省重点研发(2022ZDYF114-1);山西省农业农村厅育种联合攻关项目(YZGG-09);山西省农业农村厅育种联合攻关项目(YZGG-09-03)

旨在了解“特藏寒羊”群体遗传结构和优势性能的遗传来源，为配种方案和杂交利用提供依据，帮助组建特定性能的家系。本研究应用SNP 50K v3芯片对50只“特藏寒羊”(公羊18只，母羊32只)、24只特克塞尔羊(公母各半)和48只欧拉羊(藏系绵羊)(公羊20只，母羊28只)进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisim，SNPs)检测；使用Plink、GCTA和MegaX软件对“特藏寒羊”进行遗传结构分析；Tajima’D法对“特藏寒羊”、特克塞尔羊和欧拉羊(藏系绵羊)进行群体内基因组选择信号分析，将“特藏寒羊”的选择信号分别与特克赛尔羊和欧拉羊(藏系绵羊)的选择信号取交集进行GO和KEGG功能富集分析，找到可能影响“特藏寒羊”优势性能的亲本来源和相关基因。结果显示：“特藏寒羊”平均多态信息含量(PIC)为0.26±0.12，平均期望杂合度(He)为0.36±0.14，平均观测杂合度(Ho)为0.37±0.16，平均最小等位基因频率(MAF)为0.25±0.15，平均有效等位基因数(Ne)为1.59±0.07；ROHs长度主要分布在1~5 Mb，占比50.4%，长度20 Mb+的ROH占比9.52%，近交系数FROH中位数为0.085；遗传距离D值为0.152 7~0.349 1，平均遗传距离0.279 6；NJ聚类分析共划分5个家系，家系内个体分布不均；“特藏寒羊”与欧拉羊(藏系绵羊)交集信号定位的基因与免疫相关，包括原发性免疫缺陷、造血细胞系和T细胞受体信号通路；“特藏寒羊”与特克塞尔羊交集信号定位的基因与生物代谢相关。综上所述，“特藏寒羊”存在一定程度近交，需加强管理；欧拉羊(藏系绵羊)更影响“特藏寒羊”免疫功能，特克塞尔羊更影响“特藏寒羊”生长发育和肉质性状。

来源：2024年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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