畜牧兽医学报

作者：李继桐, 朱彤, 吕俊峰, 高月花, 胡峰, 于可响, 宋敏训, 王建琳, 李玉峰

单位：1. 山东省农业科学院家禽研究所，济南 250100；2. 青岛农业大学动物医学院，青岛 266109

关键词：新型微RNA病毒,分离鉴定,基因组测序,遗传进化分析

基金：中韩国际合作项目(122014-2);山东省家禽产业技术体系(SDAIT-11-01);国家自然科学基金(32002286);山东省自然科学基金(ZR2020QC195)

分离新型鸭源微RNA病毒进行全基因组测序并进行遗传进化分析。对本实验室2021年不同来源的种鸭和肉鸭病料进行PCR检测，初步确定存在一种未知分类的新型微RNA病毒感染。取病死鸭病料组织处理后接种SPF鸡胚分离病毒，设计引物对分离到的病毒进行PCR检测，通过重叠PCR方法进行全基因组扩增测序。将分离病毒各蛋白氨基酸序列两两比对，同时选取GenBank数据库中微RNA病毒代表毒株序列绘制系统进化树，并对主要蛋白P1、2C、3D序列比对分析。结果显示：共分离到三株微RNA病毒，分别命名为21101株、21016株和21075株(GenBank登录号：OQ927377~OQ927379)。基因组长度分别为7 445、7 445和7 447 bp，均包含一个编码2 141个氨基酸的开放阅读框(ORF)，可划分为P1、P2、P3三个部分，符合微RNA病毒序列特征。基于全基因组序列遗传进化分析发现，三株分离病毒与本实验室前期分离的Duck/FC22/China/2017(GenBank登录号：MN102111)毒株及上海兽医研究所分离的Duck/AH15/CHN/2015(GenBank登录号：MT681985)位于同一分支，与鸭甲型肝炎病毒(Duck hepatitis A virus，DHAV)遗传距离最近。分离的三株鸭源微RNA病毒进行全基因组测序及遗传进化分析发现，与目前已知的两株微RNA毒株为同一类新型鸭源微RNA病毒。

来源：2024年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2024年第7期