畜牧兽医学报

作者：曹玉珠, 邢雨欣, 马乘霖, 管宏波, 贾其辉, 康相涛, 田亚东, 李转见, 刘小军, 李红

单位：1. 河南农业大学动物科技学院, 郑州 450046;2. 河南省家禽育种国际联合实验室, 郑州 450046;3. 河南省鸡种质资源创新与利用重点实验室, 郑州 450046

关键词：鸡,FGF6基因,生物信息学分析,连锁不平衡分析,单倍型,经济性状,关联分析

基金：河南省重大科技专项(221100110200);中原学者首席科学家工作室(30601985)

旨在探究鸡成纤维细胞生长因子6(fibroblast growth factor 6, FGF6)基因的生物学特性，挖掘FGF6基因单核苷酸多态性(SNP)位点并分析其与经济性状的相关性，为后续研究鸡FGF6基因对生长性状的影响提供参考。本研究对FGF6蛋白序列进行生物信息学分析；基于768只固始鸡-安卡鸡F2资源群的GBS数据及相关经济性状表型数据对FGF6基因包含启动子2 kb区域SNP位点进行筛选，并进行连锁不平衡和关联分析，探究FGF6基因SNP和单倍型与鸡经济性状的相关性。生物信息学分析结果显示，鸡FGF6氨基酸序列与火鸡同源性为91.26%；系统进化分析表明，鸡FGF6与火鸡亲缘关系最近，其次是绿海龟，与斑马鱼遗传距离最远；保守性分析显示不同物种间FGF6保守性较高。鸡FGF6蛋白为亲水性蛋白、存在1个跨膜区，主要定位于细胞质；其二级、三级结构相符。鸡FGF6蛋白被22个磷酸化位点和1个N-糖基化位点修饰；与其受体家族FGFR1~4和EGF存在互作关系。鸡FGF6基因启动子区域筛选到6个SNPs位点，均位于1号内含子上；多态性分析显示6个SNPs位点存在高多态性，其中5个处于哈代-温伯格平衡，呈强连锁状态(D′=1，r2=1)。关联分析结果显示，rs73399071位点与F2资源群不同阶段体重(BW)、胫长(SL)、胫围(SG)、体斜长(BSL)等17个生长性状指标显著相关(P＜0.05)，与全净膛重(EW)、半净膛重(SEW)、屠体重(CW)、胸肌重(BMW)等10个屠体性状指标显著相关(P＜0.05)，与肉质性状的关联未达到显著水平(P＞0.05)，与高密度脂蛋白(HDL)和胆碱酯酶(ChE)显著相关(P＜0.05)，CC基因型个体的大部分性状表型均值高于GG基因型个体；单倍型组合分析显示不同阶段CCTTCCTTCC组合个体的体重均高于其他单倍型组合个体。本研究结果为进一步探究鸡FGF6基因的功能提供理论参考，筛选到FGF6基因存在5个与固始鸡-安卡鸡F2资源群体重、体尺、屠体性状和血液生化指标显著关联的SNPs位点，为鸡育种提供候选的分子标记，为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。

来源：2024年第4期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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