国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:杨杨, 余乾, 刘昱成, 杨华, 赵卓, 王立民, 周平, 杨庆勇, 代蓉
单位:1. 新疆农垦科学院, 省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室, 石河子 832000;2. 华中农业大学信息学院, 武汉 430070
关键词:绵羊,MYL,基因家族,生物信息学分析,基因表达
基金:兵团农业创新工程(NCG202221);省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室重大项目(2021ZD01);省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室建设(2022CA002)
为了解肌球蛋白轻链(myosin light chain,MYL)基因家族在绵羊中的分子进化关系及表达变化,本研究利用生物信息学方法对绵羊MYL基因家族进行鉴定和系统分析。各选取了3只军垦白肉羊、新疆细毛羊和湖羊成年公羊各组织样品,采用qRT-PCR方法验证家族成员MYL1、MYL6B和MYLPF基因的表达情况。结果显示,12个MYL基因分布在9条染色体上,编码由147~211氨基酸组成的亲水性蛋白质,无信号肽和跨膜结构域,二级结构以α-螺旋为主。根据基因结构、保守结构域和基序分布等特征,可以将这些基因家族成员分为3个组。共线性分析结果表明,MYL2和MYL10、MYL2和MYLPF存在片段复制,且这些片段受到较强的选择压力。蛋白互作网络显示MYH10与绵羊MYL家族成员均存在互作关系。MYLs的组织表达模式差异较大,其中MYL1、MYL2、MYL6B和MYLPF在骨骼肌组织中高水平表达。基因克隆测序结果显示,扩增得到目的基因的CDS全长,qRT-PCR结果表明,MYL1、MYL6B和MYLPF在军垦白肉羊肌肉组织中的表达水平显著高于其他组织(P < 0.000 1),并且在军垦白肉羊骨骼肌中的表达水平显著高于湖羊和细毛羊(P < 0.000 1)。以上结果为深入研究绵羊MYL基因家族的功能以及优化绵羊肉用性能提供了线索。
来源:2024年第4期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部