畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2024年第4期:基于16S rRNA测序分析高低饲料转化率猪粪便微生物的组成差异

发布日期:

作者:张帅, 陈奎蓉, 许迪, 江山, 王梦影, 张坤, 徐玉培, 雷国凤, 张志程, 郭猛, 赵云翔, 兰干球, 梁晶

单位:1. 广西大学动物科学技术学院 广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室, 南宁 530004;2. 广西扬翔股份有限公司, 贵港 537100

关键词:饲料转化率,16SrRNA,粪便微生物

基金:国家重点研发计划(2022YFD1601307);广西研究生教育创新计划项目(YCSW2023078);广西大学大学生创新项目(S202210593369)

提高猪饲料转化率是目前猪育种工作的重点,本研究对384头三元杂交母猪的FCR值进行排序,从中选取两端高饲料转化率(HFCR组)和低饲料转化率(LFCR组)猪各10头,采集粪便进行微生物16S rRNA基因测序分析。结果表明,LFCR组的Richness指数、Chao1指数、ACE指数均极显著高于HFCR组(P<0.01)。通过LEfSe分析,在属水平上筛选两组间具有显著差异的微生物,其中,在LFCR组筛选LDA>3的微生物主要是Prevotella_1、Treponema_2、Prevotellaceae_NK3B31_group、Eubacterium_coprostanoligenes_group、p-1088-a5_gut_group、Prevotella_9、阿克曼菌属、Prevotellaceae_UCG_009、Ruminococcaceae_UCG-014、Ruminococcaceae_NK4A214_group,在HFCR组LDA>3的微生物主要是巨球藻属、小类杆菌属、链型杆菌属、假丁酸弧菌属、柯林斯氏菌、Solobacterium、罕见小球菌属、链球菌属。Spearman相关性分析结果表明,与FCR显著负相关的微生物大多与短链脂肪酸的产生有关,而与FCR显著正相关的微生物多数为潜在的致病性细菌。本研究通过筛选高、低饲料转化率猪粪便中的差异微生物,并对差异微生物丰度与饲料转化率性状进行相关性分析,最终筛选到与饲料转化率显著关联的粪便微生物,为猪饲料转化率性状的肠道微生物育种标记筛选提供一定参考。

来源:2024年第4期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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