畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2024年第3期:鹅源副鸡禽杆菌全基因组重测序及比较基因组学分析

发布日期:

作者:苏文楠, 刘佳琪, 钟嘉诚, 陈济铛, 朱婉君, 张溢珊, 张济培

单位:1. 佛山科学技术学院, 佛山 528225;2. 佛山天牧生物科技有限公司, 佛山 528225

关键词:副鸡禽杆菌,比较基因组学,全基因重测序,跨物种传播

基金:广东省普通高校科研项目重点领域专项(2020ZDZX1018);横向课题(BKH20905901)

为了分析鹅源副鸡禽杆菌(Apg)与鸡源菌株的基因组差异,对3株鹅源Apg和4株鸡源Apg进行全基因重测序及基因组分析。全基因重测序结果显示7株菌株基因组片段大小为2.567 832~2.607 127 Mb,GC含量介于40.80%~40.93% 之间。SNPs同源性分析结果显示,3株鹅源菌株和鸡源C-AP3株聚集在p4chr1株的小分支上,另外3株鸡源菌株分布在其它国内菌株分支上。基因同源性分析结果显示鹅源菌株特有基因76个,鸡源菌株特有基因37个。对鹅适应性基因的筛查共聚类出79个基因,其中编码已知蛋白的基因有22个,其余编码假定蛋白;对鸡适应性基因的筛查聚类出39个基因,其中10个编码已知蛋白,29个编码假定基因。通过比较基因组学发现与Apg宿主适应性有关的基因为118个,为进一步阐释Apg跨物种感染的分子生物学机制奠定了基础。

来源:2024年第3期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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