畜牧兽医学报

作者：刘益丽, 唐娇, 闵奇, 杨露, 王泽宁, 胡莲, 赵迪, 江明锋

单位：1. 西南民族大学畜牧兽医学院, 成都 610041;2. 西南民族大学青藏高原研究院, 成都 610041

关键词：不同年龄段,牦牛,皱胃,转录组,发育,代谢

基金：四川省自然科学基金项目（2022NSFSC1665）；西南民族大学科研启动金资助项目（RQD2022048）；四川省区域创新合作项目（2023YFQ0076）；四川省重点研发项目（2021YFYZ0001；2021YFN0001）

旨在比较不同年龄段牦牛皱胃指数测定、转录组表达谱的变化，挖掘影响牦牛皱胃发育代谢的信号通路和关键基因，为进一步探讨牦牛皱胃发育机制提供理论基础。本研究对1日龄、20日龄、60日龄、15月龄与3岁的牦牛皱胃组织进行转录组测序，对转录组数据进行质控、比对、差异表达基因筛选，并对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG富集分析。为进一步验证测序数据的可靠性，随机选取5个差异表达基因进行qRT-PCR验证。结果显示，在发育过程中，瘤胃重的增长最快，其次是瓣胃、网胃和皱胃。转录组结果显示，以1日龄组为对照，在20日龄、60日龄、15月龄和3岁组中分别鉴定到1 310、1 715、1 931和2 199个差异表达基因，4个组共有基因565个；以前一个时间点为对照，20日龄、60日龄、15月龄和3岁组分别鉴定到1 310、861、569和597个差异表达基因，4个对比组共有基因9个。GO功能注释发现，以1日龄组为对照，20日龄、60日龄、15月龄和3岁组分别富集到1 191、2 578、1 117和2 835条显著条目，不同年龄组的前10条显著性GO条目中有共有的，也有各年龄阶段特有的条目。KEGG富集分析结果显示，20日龄、60日龄、15月龄和3岁4个年龄段的前30条显著通路中特有信号通路分别为4、1、3和4条，包括ECM受体相互作用、细胞色素P450对外源性物质的代谢和药物代谢-细胞色素P450等与皱胃发育相关的通路。qRT-PCR结果与测序结果基本一致，表明测序结果可靠。通过对牦牛不同发育阶段皱胃组织的转录组测序及生物信息学分析，筛选到与皱胃发育相关的差异表达候选基因，这些基因主要参与胃粘膜上皮细胞增殖分化、细胞分化和免疫调控等过程，其中GKN1、CXCL17、SCNN1B、SCNN1G、CCL5和IGF2BP3等基因可能在牦牛皱胃发育过程中起着重要作用；进一步筛选到参与皱胃葡萄糖代谢、葡萄糖转运、脂肪酸转运、肽转运等过程相关的信号通路和候选基因，其中GANAB、GBA2、SLC2A1、SLC2A3、SLC2A4、CPT1B、SLC15A1等是与牦牛皱胃组织营养代谢和吸收相关的重要候选基因。

来源：2024年第1期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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