畜牧兽医学报

作者：徐婷婷, 齐芬芳, 黄世会, 牛熙, 李升, 冉雪琴, 王嘉福, 谢健

单位：1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学农业生物工程研究院, 贵阳 550025;3. 遵义医科大学医学遗传学教研室, 遵义 563000

关键词：香猪,结构变异,MAP3K4基因,多态性,肺

基金：国家自然科学基金(31960641);贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615);贵州省"百"层次创新型人才培养项目(黔科合人才[2016]4012号);贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK[2021]一般103)

基于前期比较基因组学分析,在香猪的丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶4(mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4,MAP3K4)基因第15内含子中发现一个189 bp的结构变异(MAP3K4-I15-sv189)。为探究该结构变异(structural variation,SV)在香猪群体中的多态性分布及其对基因表达的影响,本研究设计一对特异性引物,建立MAP3K4基因SV的PCR检测技术,分析香猪群体中该结构变异的基因类型;采用RT-qPCR研究结构变异不同基因型之间基因的差异表达。结果显示,香猪群体中MAP3K4-I15-sv189位点存在两种基因型,DD型和ID型(D为缺失基因,I与参考基因一致),其中D等位基因的频率为97.35%;大白猪群体中检测到3种基因型,DD型、ID型和II型,D等位基因频率为80%。相比之下,香猪的D等位基因频率显著高于大白猪的相应值(PID型>II型,表明SV的缺失可能促进MAP3K4基因的表达。本研究表明,香猪MAP3K4的结构变异MAP3K4-I15-sv189以缺失型为主,缺失型可促进肺组织MAP3K4基因的表达。研究结果有助于解析香猪易感肺部疾病的分子机制。

来源：2023年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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