畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2023年第12期:基于转录组测序挖掘槐山羊高繁关键候选基因

发布日期:

作者:韩浩园, 李世凯, 杨瑞巧, 李曼曼, 李君, 哈斯, 赵金艳, 魏红芳, 权凯

单位:1. 河南牧业经济学院动物科技学院, 郑州 450046;2. 华南农业大学动物科学学院, 广州 510642

关键词:槐山羊,产羔数,转录组,差异表达基因

基金:河南省重点研发与推广专项(科技攻关)(222102110024);河南省现代农业产业技术体系建设专项资金(HARS-22-15-S)

为了探究山羊繁殖性状的内在分子调控机制以及基因调控网络。本研究选取健康无病的3岁左右、体格大小相似的第3胎次母羊,依据繁殖性能记录,采集3只平均胎产羔数为1只的母羊为单羔组,采集3只平均胎产羔数大于2只的母羊为多羔组。采用转录组测序技术进行mRNA文库构建、单羔组与多羔组间差异表达基因筛选及功能鉴定,通过实时荧光定量PCR技术验证基因表达量。本研究构建了6个槐山羊卵巢组织mRNA文库,平均reads总数为41 163 239条,clean reads数为37 908 182条。差异表达分析在多羔与单羔组间共发现121个差异表达基因(P<0.05),其中上调基因30个,下调基因91个。PTX3、MMP13、PAK1、ADAMTS1、COL1A2、CCN1、SLC4A10、FOS、NR4A1、NR4A2和ADCY8等11个基因在单羔与多羔组间表达差异显著(P<0.05),且参与组织器官结构发育功能及内分泌系统醛固酮、皮质醇、催产素和促肾上腺皮质激素等激素分泌;在上述11个基因中共发现236个SNPs,其中7个SNPs为错义突变,4个位于ADAMTS1基因,1个位于PTX3基因,2个位于CCN1基因。本研究结果表明,11个基因在单羔组与多羔组间表达量差异显著,且参与组织器官结构发育及内分泌系统的激素分泌,可能与山羊卵泡发育、排卵及类固醇激素分泌有关,为阐明槐山羊多胎性状遗传机制提供科学依据。

来源:2023年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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