畜牧兽医学报

作者：陶洁, 李本强, 程靖华, 石迎, 刘佩红, 刘惠莉

单位：1. 上海市农业科学院畜牧兽医研究所, 上海 201106;2. 上海市农业遗传育种重点实验室, 上海 201106;3. 农业农村部区域特色畜禽品种疾病防控重点实验室(部省共建), 上海 201106

关键词：肉鸽,宏基因组学,肠道菌群,抗生素耐药基因

基金：上海市肉鸽产业技术体系(沪农科产字(2022)第12号);动物疾病防控团队(沪农科卓[2022]012)

本研究旨在利用宏基因组学深入分析上海某鸽场青年鸽(RP)和产鸽(LP)粪便样品的微生物菌群差异。结果显示,肉鸽肠道菌群的优势菌门为厚壁菌(Firmicutes)、变形菌(Proteobacteria)和放线菌(Actinobacteria)。RP组中双歧杆菌(Bifidobacterium)、棒状杆菌(Corynebacteriun)、嗜冷杆菌(Psychrobacter)、链球菌属(Streptococcus)含量显著高于LP组,而LP组金黄色葡萄球菌属(Staphyloccus)、短状杆菌属(Brachybacterium)、库特氏菌属(Kurthia)和埃希氏菌属(Escherichia)含量显著高于RP组。LEfSe分析显示,LP和RP组的差异表达基因主要富集于5个KEGG通路。抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes,ARGs)鉴定显示,肉鸽体内存在198种ARGs,其中多重耐药类ARGs流行率40%以上,说明该场肉鸽抗生素耐药情况较严重。本研究为后续深入研究肠道菌群与健康养殖、抗生素耐药机制等提供了科学数据。

来源：2023年第12期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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