国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:陈雪娇, 刘会杰, 臧蕾, 冯静, 鹏达, 张浩
单位:1. 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所, 拉萨 850009;2. 中国农业大学动物科学技术学院, 高原畜禽遗传资源研究中心, 北京 100193)
关键词:雪域白鸡,白来航鸡,低氧适应,心脏,转录组
基金:西藏自然科学基金项目(XZ202101ZR0061G);国家现代农业产业技术体系(CARS-40)
旨在通过分析白来航(White Leghorn,WL)和雪域白鸡(Xueyu White chicken,XYW)在低氧条件下孵化时胚胎心脏组织的基因表达差异,挖掘鸡胚低氧适应候选基因。本研究在高海拔环境孵化雪域白鸡和白来航鸡种蛋,采集孵化第16天胚胎心脏组织,提取RNA,进行转录组测序(RNA-seq),筛选差异表达基因(DEGs),并对其进行荧光定量PCR (qRT-PCR)验证、功能富集分析和构建转录因子-靶基因调控网络,鉴定与雪域白鸡低氧适应相关的候选基因。在雪域白鸡和白来航鸡的心脏组织之间筛选到253个DEGs,随机选择5个DEGs进行qRT-PCR验证,表达趋势与测序结果一致。功能富集分析表明,DEGs主要涉及心血管发育和心脏功能相关的生物学过程和信号通路。将DEGs和已知的鸡转录因子对比,筛选到FOXP2和HOXA2,参与调控血管生成、心肌收缩等,对雪域白鸡胚胎低氧适应起关键作用。本研究通过鸡胚心脏组织转录组数据分析,鉴定到TENM2、NOG、SMOC1、CCBE1等鸡胚高原低氧适应候选基因,为解析雪域白鸡高原低氧适应分子机制提供理论依据。
来源:2023年第10期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部