畜牧兽医学报

作者：王志远, 刘博奇, 许志颖, 徐思佳, 邢家宝, 张桂红, 王衡, 孙彦阔

单位：1. 华南农业大学兽医学院, 广东省临床重大疾病综合防控重点实验室, 广州 510642;2. 岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心, 茂名 525000;3. 华南农业大学国家生猪种业工程技术研究中心, 广州 510642;4. 广东海大畜牧兽医研究院有限公司, 广州 511400

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒,ORF5,系统发育学分析,NADC30,NADC34

基金：国家自然科学基金项目(32102704);茂名实验室科研启动项目(2021TDQD002);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系

为深入了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)的流行和遗传变异情况,2021-2022年,本课题组在我国13个省份约50个养殖场收集了117份临床疑似猪繁殖与呼吸综合征患猪样品,针对PRRSV的ORF5基因进行了遗传变异分析。通过实时荧光定量PCR鉴定PRRSV阳性样品和基因型,应用RT-PCR扩增PRRSV ORF5和ORF7基因,将阳性样本进行测序并开展系统发育学分群和GP5氨基酸突变分析。结果显示,共检出PRRSV-2阳性样品48份(总体阳性率约41%),经测序共获取38条ORF5序列和10条ORF7序列。所有ORF5序列间核苷酸相似性为77.1%~99.8%,ORF7序列间核苷酸相似性为83.3%~98.7%。系统发育学分群显示,谱系1占比60%(29/48,28株NADC30-like毒株,1株NADC34-like毒株),谱系3占比25%(12/48),谱系5.1占比5%(2/48),谱系8.7占比10%(5/48)。GP5氨基酸分析表明,信号肽(aa 1-26)、中和表位C(aa 52-61)及潜在的N-糖基化位点(aa 32-35、aa 44、aa 51)3个区域氨基酸存在显著变异。研究结果表明:多个谱系PRRSV同时在我国流行,谱系1已替代谱系8.7成为主要流行谱系,并分布于我国大多数省份;谱系3仅次于谱系1,主要在华南局部地区流行;谱系8.7毒株检出率较低。需要注意的是,在广东省惠州市检出1株NADC34-like毒株,说明该毒株可能已在华南地区潜在流行。近几年来,PRRSV在我国的流行日趋复杂,谱系1毒株的广泛流行增加了PRRSV的遗传多样性。本研究结果将为制定PRRSV防控策略提供参考。

来源：2023年第9期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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