畜牧兽医学报

作者：刘弘毅, 罗霆宇, 李昌文, 于海波, 路小野, 陈洪岩, 夏长友, 高彩霞

单位：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所, 动物疫病防控全国重点实验室, 黑龙江省实验动物与比较医学重点实验室, 国家禽类实验动物资源库, 哈尔滨 150069

关键词：荣昌猪,SLA-1等位基因,鉴定,分子特征

基金：国家重点研发计划项目（2021YFF0703000）；国家自然科学基金（31872313）；中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（1610302022018）；兽医生物技术国家重点实验室课题（SKLVBP202120；SKLVBP202101）

旨在明确实验用荣昌猪SLA遗传背景，深入研究SLA-1分子相关的抗原递呈和免疫应答机制，本研究对27头荣昌猪采集抗凝血，分离外周血淋巴细胞，提取总RNA，设计特异性引物对SLA-1基因进行RT-PCR扩增、克隆和测序，对获得序列的分子特征进行分析。结果显示，荣昌猪中共获得11个SLA-1等位基因，其中，9个为新等位基因，全部获得GenBank登录号和ISAG SLA命名委员会官方命名，SLA-1*24：01等位基因在该群体中频率最高。SLA-1基因编码区全长1 086 bp，存在127个核苷酸多态位点，非同义单核苷酸多态性位点数高于同义单核苷酸多态性位点数。核苷酸多样度为0.044 9，单倍型多样度为1，平均核苷酸差异数为48.782，G+C含量为64.9%。SLA-1基因编码的361个氨基酸中，有75个氨基酸变异位点；第2和第3外显子编码区多态性最高，且第2外显子区域的氨基酸变异程度高于第3外显子区，组成抗原肽结合槽6个口袋的33个关键氨基酸位点中，11个在人与荣昌猪之间高度保守，与β2-微球蛋白结合的19个关键氨基酸位点中，10个保持一致，CD8分子与MHC结合的关键氨基酸位点中，只有225（Thr/Ser）和228（Thr/Met）位点不同。同源性和系统进化树分析表明，SLA-1*10：03和SLA-1*18：03分别与人HLA-A*02：01和HLA-A*11：01等位基因的同源性最高，荣昌猪与亚洲野猪、巴马小型猪和融水小型猪等亚洲猪种具有较近的亲缘关系。本研究成功获得了中国地方猪种荣昌猪SLA-1基因，发现其具有极为丰富的多态性，为揭示荣昌猪的SLA遗传背景和开展异种移植研究奠定了遗传学基础。

来源：2023年第7期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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