畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2023年第6期:细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析

发布日期:

作者:杜小迪, 侯巍, 苏中华, 马青梅, 何雪, 华瑞其, 阳爱国, 杨光友

单位:1. 四川农业大学动物医学院, 成都 611130;2. 四川省动物疫病预防控制中心, 成都 610041;3. 西藏自治区 动物疫病预防控制中心, 拉萨 850000;4. 青海省海北州海晏县畜牧兽医站, 海晏 810200

关键词:细粒棘球绦虫,泛素结合酶基因家族,生物信息学,转录水平分析

基金:四川省科技厅重点研发项目(2022YFN0013)

本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对EgE2s基因家族进行T-A克隆、生物信息学分析以及采用qRT-PCR法检测了这些基因在原头蚴(Protoscolex, PSCs)和28日龄童虫中的转录水平。结果成功克隆并测序19个EgE2s基因,更正了两个原序列有误的EgE2s,分别为EgE2L3(登录号:MZ277618); EgE2J1(登录号:MZ277619)。三级结构和保守基序预测结果表明EgE2s高度保守。qRT-PCR结果显示,EgE2s的转录水平在PSCs和28日龄童虫中存在差异,其中EgE2A(P<0.001)、EgE2J1(P<0.01)在PSCs阶段高表达。B细胞抗原表位预测表明EgE2N的139-157区域位于EgE2s保守基序外。同时,T细胞抗原表位预测表明EgE2N与人和犬MHC Ⅰ类分子各有两个强结合位点,且有一个共同的抗原表位位点104-113。综上,EgE2A和EgE2J1可能在PSCs的生长发育中起重要作用。EgE2N的139-157和104-113区域可能是药物研究和疫苗开发的靶序列。

来源:2023年第6期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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