畜牧兽医学报

作者：王子渲, 王巧, 张锦, Astrid Lissette Barreto Sánchez, 郑麦青, 李庆贺, 崔焕先, 安炳星, 赵桂苹, 文杰, 李和刚

单位：1. 青岛农业大学动物科技学院, 青岛 266109;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

关键词：北京油鸡,广明白鸡,热应激,差异表达基因,加权基因共表达网络分析

基金：国家重点研发计划(2018YFE0128000);国家自然科学基金(32072708);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-41);农业科技创新计划(ASTIP-IAS04; CAASZDRW202005)

旨在通过对北京油鸡(BY)和"广明2号"白羽肉鸡B系(广明白鸡,GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析,鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路,解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡,测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据,采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据,结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明,热应激组相比于对照组,北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因,其中169个上调表达,144个下调表达;广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因,其中152个上调表达,83个下调表达。利用WGCNA分析,在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块,在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因,发现两品种中均存在TRIM29基因,说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析,揭示了不同鸡种在热应激下基因的表达差异规律,并鉴定到与耐热相关的候选基因,为进一步研究鸡的耐热机制提供了新的思路和线索。

来源：2023年第5期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2023年第5期