畜牧兽医学报

作者：刘建奎, 徐叶, 刘辰, 于慧, 杨圆, 何乐, 李佳睿, 但惠娟, 戴爱玲, 杨小燕, 魏春华

单位：1. 龙岩学院生命科学学院, 龙岩 364000;2. 福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室, 龙岩 364000;3. 福建农林大学动物科技学院, 福州 350002

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒,病毒分离鉴定,全基因组,遗传变异,基因重组

基金：中央引导地方科技发展专项（2021L3028）；福建省科技重大专项（2019NZ09005）；福建省科技厅引导项目（2021N0032）；奇迈基金项目（2019SHQM06；2020SHQM07）

通过对福建地区规模化猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV）进行病毒分离及全基因组序列分析，从而了解PRRSV流行情况及基因组特征，为猪场防控PRRS提供理论基础。2017—2021年从福建地区规模化猪场采集疑似感染PRRSV的组织病料和血清，进行病毒分离鉴定，采用RT-PCR方法对PRRSV分离株进行全基因组序列扩增，应用DNAstar 7.0软件进行序列分析，使用MEGA 7.0软件邻近法进行遗传演化分析，并利用生物软件SimPlot 3.51和RDP4.10对PRRSV基因组序列进行重组分析。成功分离得到32株PRRSV-2，其全基因组大小为14 938~15 439 bp （不包括ployA），32株PRRSV之间基因组核苷酸相似性为82.4%~99.4%，与PRRSV-2代表毒株（VR-2332、JXA1、NADC30、QYYZ）和PRRSV-1代表毒株（LV）之间核苷酸相似性分别为81.4%~99%和59.8%~60.6%。分别基于PRRSV全基因组与ORF5基因构建的遗传进化树对32株PRRSV进行分型，结果显示福建省呈现多种谱系毒株并存，两种分型结果符合率为75%（24/32）。PRRSV基因组中Nsp2和ORF5的变异程度最大，Nsp2蛋白存在不同程度的氨基酸（1~155aa）缺失，GP5蛋白主要中和表位发生广泛的变异。32株PRRSV存在较高的重组概率（27/32）且重组模式复杂多样，重组模式有9种：L1+L8、L1+L3、L8+L5、L8+L3、L1（Sublineage1.8+Sublineage1.5）+L8、L1+L5+L8、L1+L3+L8、L1+L3+L5、L1+L3+L5+L8，其中19株以NADC30-like PRRSV为主要亲本，重组方式主要为L1+L8和L1+L8+L3，重组热点主要分布在Nsp1、Nsp2、Nsp9和ORF3基因。综上，福建省主要流行毒株为以NADC30-like PRRSV为主要亲本的重组毒株，对PRRSV进行分型应当以全基因组结果为准。

来源：2023年第4期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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