畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2023年第4期:基于16S rRNA测序分析PRRSV感染仔猪肺和肠道中微生物菌群的变化

发布日期:

作者:陆梦琪, 杨文杰, 李萍, 余鹏, 董翎, 牛晓玉, 杨克礼, 邹维华, 宋卉

单位:1. 华中农业大学动物科技学院动物医学院, 武汉 430070;2. 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所, 武汉 430070;3. 武汉科前生物股份有限公司, 武汉 430070

关键词:繁殖与呼吸综合征病毒,肺部微生物,肠道微生物,16SrRNA基因测序

基金:农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室畜禽病原微生物学和湖北省重点实验室开放课题项目(KLPCAAB-2021-02);中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(2662020DKPY001)

本试验旨在探究猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)感染对仔猪肺、肠道中的菌群影响以及肺和肠道的组织学变化。试验选取35日龄断奶健康仔猪14头,适应性饲养7 d,随机分为感染组(n=7)和对照组(n=7),感染组仔猪接种2 mL 1×105 TCID50·mL-1PRRSV-JTS毒株病毒液,对照组仔猪接种2 mL DMEM培养基。感染组3头仔猪分别于10、12和19 d死亡,将存活的感染组与对照组仔猪于21 d后处死,并取肺、不同肠段组织样品以及肠道内容物。采用免疫组化染色和HE染色观察肺和肠道组织病理学变化,并基于16S rRNA基因的高通量测序分析仔猪肺和各肠段菌群结构。结果表明,感染组仔猪肺部和肠道均有病毒分布;与对照组仔猪相比,感染组仔猪肺部和肠道均存在明显的炎症反应。微生物组成结构及多样性分析显示,感染组仔猪Chao1、ACE指数在肺中上升,在仔猪各肠段中下降,Shannon、Simpon指数在肺中升高,在大多数肠道中下降。在门水平上,感染仔猪肠道变形菌门等有害微生物比例增加,而厚壁菌门等有益微生物比例下降;在科水平上,感染组肺、空肠中巴斯德菌科,十二指肠乳杆菌科,回肠肠杆菌科,盲肠、结肠、直肠中的瘤胃菌科相对比例有明显的下降,假单胞菌科在肺和十二指肠中的比例明显上升;在属水平上,感染组有益菌属乳酸菌属水平显著下降,β多样性证明小肠与大肠聚类效果具有一致性。综上,PRRSV致仔猪肺部病变和肠道炎症,影响肺部和肠道菌群组成、丰度和功能。

来源:2023年第4期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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