国内刊号:11-1985/S
国际刊号:0366-6964
发布日期:
作者:廖伟莉, 张笑科, 曾检华, 阳林芳, 李硕, 胡梦婷, 郭懿萱, 陈赞谋, 张豪, 李加琪, 袁晓龙
单位:1. 华南农业大学动物科学学院, 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室, 国家生猪种业工程技术研究中心, 广州 510642;2. 广东壹号地方猪研究院有限公司, 湛江 524000
关键词:卵巢,屠宰性状,FOXL2,SNPs,单倍型
基金:广东省重点领域研发计划(2022B0202090002);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-35);国家自然科学基金(32072694);广东省自然科学基金(2021A1515012396);广州市科技计划项目(202002030071)
旨在筛选FOXL2(forkhead box protein L2)基因与猪排卵状态和屠宰性状相关的SNPs位点,为今后两广小花猪分子育种和遗传改良提供理论和参考依据。本研究以107头(365±25)日龄两广小花猪为研究对象,使用靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing,GBTS)技术定位FOXL2基因的SNPs位点,对排卵状态、乳头数和屠宰性状进行关联分析和单倍型分析。两广小花猪FOXL2基因共检测到24个突变位点。剔除InDel突变和突变频率小于1%的SNP位点后,对得到的12个SNPs进行关联分析,其中2个位于编码区、10个位于非编码区。单SNP位点关联分析表明,g.79706726 T>C、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C、g.79709005 T>C这4个位点对排卵状态均有显著性影响(P0.05)。g.79707040 A>G、g.79708079 T>C、g.79708152 G>T、g.79706726 T>C、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C这6个SNPs位点对骨重、瘦肉率、腿臀重、左胴体重性状均有显著性影响(PG、g.79708079 T>C、g.79708152 G>T对板油重性状有显著性影响(PC、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C这3个位点处于强连锁区域内(r2>0.9)。H1H2单倍型组合(g.79706726 T>C和g.79706898 C>T)对排卵状态、骨重、瘦肉率、腿臀重、左胴体重性状均有显著性影响(PC、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C、g.79709005 T>C等SNPs位点。另外,本研究发现了FOXL2转录因子与猪屠宰性状相关的SNPs位点,表明FOXL2转录因子除了维持卵巢表型和功能以外,还影响猪的重要经济性状。本研究为FOXL2基因在两广小花猪的选种选育中提供重要参考,为分子标记辅助选择提供理论依据。
来源:2023年第3期
《畜牧兽医学报》期刊编辑部