畜牧兽医学报

作者：马志杰, 王世康, 张卫忠, 郭卫兴, 赵海明, 雷初朝

单位：1. 青海大学畜牧兽医科学院, 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室, 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室, 西宁 810016;2. 西北农林科技大学动物科技学院, 杨凌 712100;3. 青海省格尔木市畜牧兽医站, 格尔木 816000;4. 青海省格尔木市乌图美仁乡畜牧兽医站, 格尔木 816000

关键词：柴达木牛,蒙古牛,Y染色体基因组,SNP,父系起源

基金：青海省自然科学基金项目(2021-ZJ-914)；国家肉牛牦牛产业技术体系(CARS-37)；青海省“昆仑英才·高端创新创业人才”计划项目

旨在从基因组水平探究柴达木牛和蒙古牛的父系遗传多样性和起源进化关系。本研究采用全基因组重测序技术对柴达木牛品种5个不同地理群体共计22个个体和蒙古牛23个个体的Y染色体单拷贝基因区进行SNP扫描，使用生物信息学方法分析其父系遗传多样性和系统发育关系。结果表明，22头柴达木牛共定义了4种单倍型，其单倍型多样度为0.610±0.093，核苷酸多样度为0.074±0.015，而23头蒙古牛共确定了10种单倍型，其单倍型多样度为0.925±0.025，核苷酸多样度为0.137±0.013，表明柴达木牛相比蒙古牛其父系遗传多样性较低。构建的系统发育树和单倍型网络图表明，22头柴达木牛明显地分为Y1(18.2%)和Y2(81.8%)两个单倍型组，其中Y2为优势单倍型组，Y2单倍型组又包括Y2a(18.2%)与Y2b(63.6%)两种亚单倍型组，其中Y2b亚单倍型组占优势，表明柴达木牛有Y1与Y2 两个父系起源；蒙古牛也拥有Y1(17.4%)和Y2(82.6%)两个父系起源，但Y2单倍型组以Y2a为主要亚单倍型组(47.8%)。上述结果表明，柴达木牛和蒙古牛具有相似的父系遗传组成，但考虑到柴达木牛的父系遗传多样性较低，故建议加大该品种内群体间种公牛的基因交流，提高其遗传多样性水平。本研究为明确柴达木牛和蒙古牛父系遗传差异，开展其种质资源的保护和开发利用提供了理论依据。

来源：2023年第3期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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