畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2023年第3期:猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学分析

发布日期:

作者:蒋增海, 滕霖, 贺安文, 刘言言, 乐敏, 何启盖

单位:1. 河南牧业经济学院动物医药学院, 郑州 450046;2. 浙江大学动物科学学院动物医学系&动物预防医学研究所, 杭州 310058;3. 华中农业大学动物医学院, 武汉 430070

关键词:沙门菌血清型4,[5],12:i:-,鼠伤寒沙门菌单相变种,猪产业链,基因组学,耐药基因,毒力基因

基金:河南省科技攻关(212102110096);浙江省重点研发计划(2020C02032;2021C02008);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-35);河南牧业经济学院博士启动基金(2022HNUAHEDF027)

旨在探究鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学特征。采用Illumina NovaSeq 6000平台对91株河南省猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌进行全基因组测序,通过生物信息学分析,进行其血清型的预测、多位点序列的分型以及质粒类型、耐药基因和毒力基因分析。结果表明,在河南省猪产业链中沙门菌4,[5],12:i:-的流行率(1.58%, 50/3 173)已经超过鼠伤寒沙门菌的流行率(1.29%, 41/3 173);91株沙门菌的序列型分为ST34(71.42%,65/91)和ST19(28.57%,26/91);鼠伤寒沙门菌/ST34菌株和4,[5],12:i:- /ST34菌株都是 IncHI2A_1、IncHI2_1和Col440I_1质粒的偏好宿主;沙门菌血清型4,[5],12:i:-携带率较高的耐药基因是blaTEM-1B_1(72%)、tet(B)_2(90%)、sul2_3(66%)、blaOXA-1_1(34%)等;相比鼠伤寒沙门菌菌株,沙门菌血清型4,[5],12:i:-菌株中质粒的携带率更高,且携带更多种类的耐药基因和毒力基因。本研究首次证实,河南省猪产业链中沙门菌血清型4,[5],12:i:-的流行已经超过鼠伤寒沙门菌,在一定程度上解释了该血清型在河南省病人中主要流行的原因。

来源:2023年第3期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

查看畜牧兽医学报杂志2023年第3期

联系我们

  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 电话:010-62815987
  • E-mail:xmsyxb@caas.cn

咨询工作人员