畜牧兽医学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-1985/S

国际刊号:0366-6964

畜牧兽医学报杂志2023年第1期:北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析

发布日期:

作者:牛乃琪, 苏艳芳, 杨曼, 侯欣华, 王立刚, 张龙超

单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

关键词:北京黑猪,HoxB9,HoxB13,脊椎数,胴体性状

基金:国家重点研发计划项目(2021YFD1301101);国家生猪产业技术体系(CARS-35);中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202006-04)

旨在对北京黑猪HoxB簇9个基因(HoxB1-7、9和13)的多态性与脊椎数和胴体性状(胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重)进行关联分析。本研究提取251头220日龄的健康北京黑猪耳组织DNA,对HoxB簇的9个基因通过引物设计、聚合酶链式反应(PCR)技术、Sanger测序技术等对SNPs进行基因分型,并计算变异位点基因型频率以及等位基因频率分布,并与脊椎数和胴体性状进行关联分析。结果,本试验共筛选到4个基因共12个非编码区的(UTR)SNPs,包括HoxB2基因的1个5'UTR突变、HoxB5基因的2个3'UTR突变、HoxB9基因的2个3'UTR突变以及HoxB13基因的7个3'UTR突变。将12个SNPs分别与脊椎数和胴体性状使用Duncan's多重检验统计分析发现,HoxB2基因的1个5'UTR突变(c.40 C>T)、HoxB5基因的2个3'UTR突变(c.1766 A>G、c.1767 A>G)均与性状关联不显著(P>0.05);而HoxB9基因中的1个3'UTR突变(c.2743 C>T)与胴体性状关联显著(PA、c.1440 A>C)与脊椎数关联显著(PT与胴体性状关联显著(PA、c.1440 A>C均与脊椎数性状关联显著(P<0.05),这3个位点可作为北京黑猪脊椎数及胴体性状变异的候选基因功能位点。

来源:2023年第1期

《畜牧兽医学报》期刊编辑部

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